81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1361 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 413 aa  800    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  40.93 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  21.31 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.07 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  22.33 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  21.09 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  22.22 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.46 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.94 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  37.63 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  26.49 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 546 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 504 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  23.81 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1817  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 583 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  27.36 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  36 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  34.34 
 
 		 135 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 		 547 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  26.98 
 
 		 495 aa  47  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 471 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.68 
 
 		 517 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 444 aa  46.6  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  19.6 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  29.23 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.09 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5393  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.376644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  23.43 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  22.74 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  19.88 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.09 
 
 		 490 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>