70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0165 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1188    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  35 
 
 
555 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  26.73 
 
 
565 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  34.23 
 
 
255 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  36.17 
 
 
464 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  29.3 
 
 
466 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  35.67 
 
 
465 aa  87.4  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  34.93 
 
 
527 aa  87  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  27.72 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  34.87 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  33.77 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  27.92 
 
 
617 aa  77.4  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  32.08 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  31.29 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  33.1 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  29.14 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  32.21 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  32.73 
 
 
510 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  29.66 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  28.57 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  29.79 
 
 
378 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  32.14 
 
 
224 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  30.19 
 
 
478 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  32.86 
 
 
459 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  30.19 
 
 
459 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  22.88 
 
 
467 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  30.34 
 
 
369 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  44 
 
 
408 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  30 
 
 
368 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  29.17 
 
 
371 aa  61.2  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  28.77 
 
 
374 aa  60.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  27.33 
 
 
483 aa  60.8  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  28.17 
 
 
377 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  39.81 
 
 
435 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  28.48 
 
 
391 aa  57.4  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.46 
 
 
605 aa  54.3  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  33.59 
 
 
628 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  30.43 
 
 
451 aa  50.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.27 
 
 
607 aa  50.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  29.55 
 
 
394 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  22.97 
 
 
227 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  32.23 
 
 
567 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  36.14 
 
 
604 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  35.62 
 
 
877 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  52.27 
 
 
645 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  47.73 
 
 
680 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  47.73 
 
 
645 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.65 
 
 
365 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  52.27 
 
 
378 aa  46.2  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  36 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2374  hypothetical protein  43.48 
 
 
579 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  38.03 
 
 
405 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  42.86 
 
 
369 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  25.27 
 
 
460 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.65 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  31.08 
 
 
131 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.86 
 
 
370 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  36.21 
 
 
131 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  39.13 
 
 
360 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 
1403 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  39.13 
 
 
360 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  39.13 
 
 
360 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  45.45 
 
 
494 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  36.11 
 
 
580 aa  43.9  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  43.48 
 
 
1225 aa  44.3  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  39.13 
 
 
360 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  40.43 
 
 
1184 aa  43.9  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  38.3 
 
 
1146 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 
1176 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 
1176 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>