17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2374 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2374  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1138    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  39.2 
 
 		 581 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1722  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 580 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198567  hitchhiker  0.0000514519 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  45.28 
 
 		 852 aa  55.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  45.28 
 
 		 852 aa  55.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  32.89 
 
 		 813 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  43.48 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.92 
 
 		 647 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  34.09 
 
 		 818 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  29.6 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.94 
 
 		 370 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  33.33 
 
 		 987 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  35.85 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  22.71 
 
 		 527 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  50 
 
 		 1003 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  31.58 
 
 		 399 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  33.87 
 
 		 360 aa  43.5  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>