More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1407 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
488 aa  954    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  61.68 
 
 
482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.59 
 
 
489 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.79 
 
 
504 aa  329  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1620  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.94 
 
 
495 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.596211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.89 
 
 
477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.52 
 
 
531 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.05 
 
 
486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.16 
 
 
496 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.16 
 
 
496 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0908  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.72 
 
 
455 aa  266  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.26 
 
 
473 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.13 
 
 
482 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.54 
 
 
474 aa  259  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.07 
 
 
464 aa  259  9e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  37.63 
 
 
479 aa  257  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  35.81 
 
 
503 aa  256  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.15 
 
 
489 aa  256  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.03 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.27 
 
 
493 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.74 
 
 
495 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.86 
 
 
481 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37 
 
 
475 aa  253  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.13 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 
495 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.24 
 
 
504 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  32.71 
 
 
479 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.39 
 
 
481 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
497 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.36 
 
 
496 aa  250  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  32.5 
 
 
489 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.6 
 
 
489 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.08 
 
 
494 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.33 
 
 
499 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  33.4 
 
 
501 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  34.71 
 
 
486 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.28 
 
 
496 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.94 
 
 
472 aa  246  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.06 
 
 
500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.76 
 
 
502 aa  244  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  30.13 
 
 
482 aa  242  9e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.19 
 
 
461 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.75 
 
 
478 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.79 
 
 
484 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.33 
 
 
470 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  36.72 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  32.49 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  34.23 
 
 
485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.24 
 
 
471 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  34.23 
 
 
485 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2194  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.69 
 
 
518 aa  240  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0247365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.38 
 
 
484 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.1 
 
 
482 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.38 
 
 
484 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.38 
 
 
484 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.84 
 
 
480 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  33.73 
 
 
512 aa  236  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.75 
 
 
486 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.19 
 
 
482 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  32.3 
 
 
495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.29 
 
 
501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.55 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  33.82 
 
 
486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  34.83 
 
 
520 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.33 
 
 
477 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.91 
 
 
477 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  35.33 
 
 
499 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  30.44 
 
 
482 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.81 
 
 
507 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.96 
 
 
472 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.89 
 
 
471 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  35.06 
 
 
474 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.43 
 
 
511 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.96 
 
 
497 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.91 
 
 
477 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.33 
 
 
473 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.66 
 
 
507 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.26 
 
 
507 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.26 
 
 
507 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.68 
 
 
471 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.04 
 
 
470 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  34.9 
 
 
470 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 
477 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.56 
 
 
471 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.05 
 
 
462 aa  229  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0690  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.96 
 
 
474 aa  229  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.81 
 
 
500 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  36.09 
 
 
492 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.47 
 
 
500 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  34.5 
 
 
491 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.23 
 
 
457 aa  227  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.94 
 
 
485 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.88 
 
 
480 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.91 
 
 
499 aa  227  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.45 
 
 
486 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  31.49 
 
 
460 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.61 
 
 
492 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.13 
 
 
507 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.33 
 
 
486 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.85 
 
 
474 aa  226  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>