More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1139 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0578  acriflavine resistance protein B  42.59 
 
 
1049 aa  763  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3491  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.6 
 
 
1052 aa  756  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0648  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.19 
 
 
1089 aa  825  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.46 
 
 
1064 aa  797  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3092  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.61 
 
 
1056 aa  1214  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185291  normal  0.0905875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  74.98 
 
 
1063 aa  1534  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0901  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.13 
 
 
1062 aa  841  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629732  normal  0.563916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5229  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.96 
 
 
1066 aa  765  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.536808  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2528  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.05 
 
 
1066 aa  751  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.149577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.46 
 
 
1058 aa  778  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4919  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.57 
 
 
1061 aa  763  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462641  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5072  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.74 
 
 
1062 aa  845  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193812  normal  0.0596255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1563  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  89.09 
 
 
1061 aa  1836  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0482838  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2637  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.14 
 
 
1066 aa  753  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.61 
 
 
1040 aa  944  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4788  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.09 
 
 
1062 aa  772  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4473  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.69 
 
 
1052 aa  749  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5504  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.19 
 
 
1089 aa  825  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2030  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.69 
 
 
1035 aa  814  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0107983  hitchhiker  0.000143133 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  42.41 
 
 
1049 aa  760  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0444  hypothetical protein  42.2 
 
 
1055 aa  766  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.97314e-09 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3656  AcrB protein  43.39 
 
 
1037 aa  790  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2674  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.98 
 
 
1037 aa  782  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0525  acriflavine resistance protein B  42.59 
 
 
1049 aa  763  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452979  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0390  hypothetical protein  42.2 
 
 
1055 aa  763  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.97308e-08 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3467  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.7 
 
 
1040 aa  749  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.379499  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1399  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.36 
 
 
1055 aa  778  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00114728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3428  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.61 
 
 
1076 aa  750  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3305  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.96 
 
 
1046 aa  793  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0100  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.87 
 
 
1049 aa  1216  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1392  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.5 
 
 
1049 aa  822  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5127  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  63.4 
 
 
1043 aa  1258  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5023  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.6 
 
 
1074 aa  808  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3746  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.53 
 
 
1050 aa  770  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756771  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3257  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.64 
 
 
1073 aa  789  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662335  normal  0.89676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.15 
 
 
1055 aa  848  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2437  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.51 
 
 
1065 aa  817  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2447  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.82 
 
 
1059 aa  761  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1025  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.69 
 
 
1050 aa  761  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.406583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.05 
 
 
1046 aa  766  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194313  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5136  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.66 
 
 
1102 aa  755  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.891075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.23 
 
 
1051 aa  762  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2193  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.94 
 
 
1044 aa  787  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.04 
 
 
1043 aa  935  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2284  acriflavin resistance protein  41.44 
 
 
1055 aa  762  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.06 
 
 
1038 aa  903  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1639  multidrug resistance protein MdtF  40.15 
 
 
1041 aa  772  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0267869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  43.44 
 
 
1034 aa  780  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.73 
 
 
1037 aa  781  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  42.41 
 
 
1049 aa  761  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  43.44 
 
 
1034 aa  780  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.93 
 
 
1037 aa  785  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  42.41 
 
 
1049 aa  761  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4353  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  77.77 
 
 
1053 aa  1635  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.76 
 
 
1059 aa  776  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0689  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.33 
 
 
1066 aa  752  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181022  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3374  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.67 
 
 
1061 aa  763  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.45 
 
 
1085 aa  783  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.83 
 
 
1037 aa  783  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  42.41 
 
 
1049 aa  761  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.41 
 
 
1049 aa  761  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.93 
 
 
1037 aa  785  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.35 
 
 
1034 aa  778  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.15 
 
 
1050 aa  764  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.45 
 
 
1043 aa  783  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0739  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.45 
 
 
966 aa  816  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.828108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.01 
 
 
1049 aa  757  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.19 
 
 
1047 aa  777  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1087  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.28 
 
 
1059 aa  770  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.08 
 
 
1050 aa  764  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.391889  normal  0.149359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2510  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.72 
 
 
1059 aa  758  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307051  normal  0.508426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4508  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.59 
 
 
1069 aa  798  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  100 
 
 
1063 aa  2112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  43.15 
 
 
1050 aa  764  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0514  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.73 
 
 
1069 aa  776  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2886  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.06 
 
 
1065 aa  856  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.418369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0040  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.26 
 
 
1055 aa  759  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.513333  normal  0.265897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3923  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.15 
 
 
1038 aa  766  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.72261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1069  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.21 
 
 
1042 aa  759  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3048  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.41 
 
 
1047 aa  755  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0601242  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03075  hypothetical protein  43.35 
 
 
1034 aa  777  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02323  hypothetical protein  41.93 
 
 
1037 aa  785  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00418  hypothetical protein  42.41 
 
 
1049 aa  761  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1010  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.51 
 
 
1047 aa  753  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.44 
 
 
1050 aa  768  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3809  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.61 
 
 
1056 aa  770  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0639553  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_3366  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.52 
 
 
1062 aa  779  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0201859 
 
 
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NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.07 
 
 
1050 aa  761  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2563  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.83 
 
 
1091 aa  760  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179005  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_44060  multidrug efflux pump HAE1-family transporter protein  45.61 
 
 
1069 aa  870  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.447353  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_33870  Multidrug efflux RND transporter MexF  42.21 
 
 
1057 aa  757  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_01890  Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.74 
 
 
1046 aa  748  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2174  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.35 
 
 
1052 aa  748  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486417  normal 
 
 
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NC_013037  Dfer_4641  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.85 
 
 
1052 aa  768  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463789  normal  0.947312 
 
 
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NC_013132  Cpin_1969  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.82 
 
 
1056 aa  783  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00020472  normal  0.0816221 
 
 
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NC_014148  Plim_2295  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.13 
 
 
1122 aa  771  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_2294  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.87 
 
 
1102 aa  771  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_1920  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.27 
 
 
1044 aa  757  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0960887  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_6591  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.92 
 
 
1072 aa  775  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.490488  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_2360  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.92 
 
 
1080 aa  775  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.216715 
 
 
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