More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2290 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  98.41 
 
 
378 aa  736  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
378 aa  748  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  86.51 
 
 
373 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  59.1 
 
 
378 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  41.24 
 
 
359 aa  244  2e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  37.61 
 
 
383 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 
364 aa  118  1e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  34.17 
 
 
361 aa  114  4e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  32.78 
 
 
354 aa  110  4e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  30.83 
 
 
358 aa  109  7e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 
347 aa  109  8e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  31.02 
 
 
347 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  31.09 
 
 
343 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  30.2 
 
 
341 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  29.83 
 
 
357 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  30 
 
 
331 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
354 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  37.05 
 
 
352 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  28.53 
 
 
348 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  30.68 
 
 
345 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  28.04 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 
278 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  30.52 
 
 
336 aa  96.7  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.54 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 
349 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.12 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 
363 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  27.3 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  27.49 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  32.65 
 
 
383 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 
504 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  33.04 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  32.33 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  35.19 
 
 
280 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  31.44 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  29.05 
 
 
289 aa  85.1  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 
424 aa  84  4e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  33.49 
 
 
444 aa  81.3  3e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.3 
 
 
268 aa  80.9  4e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.62 
 
 
494 aa  79.7  7e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  35.36 
 
 
553 aa  79.3  9e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 
333 aa  79  1e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  32.4 
 
 
453 aa  78.2  2e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 
492 aa  78.6  2e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 
483 aa  78.6  2e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  29.24 
 
 
327 aa  77.8  3e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 
349 aa  77.8  3e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 
289 aa  76.6  6e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 
398 aa  76.6  7e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  35.93 
 
 
533 aa  76.6  7e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  31.31 
 
 
353 aa  76.3  8e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.52 
 
 
268 aa  76.3  9e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 
289 aa  75.5  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  30.37 
 
 
479 aa  75.5  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.41 
 
 
502 aa  75.5  2e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  19.86 
 
 
269 aa  75.1  2e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  23.9 
 
 
279 aa  74.7  2e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 
374 aa  75.1  2e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  32.93 
 
 
377 aa  75.1  2e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 
493 aa  73.9  4e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  23.93 
 
 
260 aa  74.3  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  23.93 
 
 
260 aa  74.3  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  29.95 
 
 
442 aa  73.6  6e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  27.7 
 
 
294 aa  73.2  7e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  28.02 
 
 
351 aa  73.2  7e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
474 aa  73.2  8e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  31.31 
 
 
548 aa  72.4  1e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  29.51 
 
 
307 aa  71.6  2e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  29.91 
 
 
436 aa  70.5  4e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.76404e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  27.49 
 
 
292 aa  69.7  8e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
562 aa  69.7  9e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  27.51 
 
 
288 aa  69.3  9e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  4.10475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.41 
 
 
573 aa  69.3  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.97 
 
 
475 aa  68.9  1e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
445 aa  68.9  1e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  22.27 
 
 
335 aa  68.6  2e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  27.98 
 
 
488 aa  68.2  2e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.12 
 
 
365 aa  68.6  2e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  28.89 
 
 
282 aa  68.6  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  30.15 
 
 
514 aa  68.2  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  25.95 
 
 
541 aa  67.8  3e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
604 aa  68.2  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.9 
 
 
479 aa  67.4  4e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  29.61 
 
 
275 aa  67.4  4e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 
292 aa  67.4  4e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 
521 aa  66.6  6e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
521 aa  66.6  6e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  31.7 
 
 
529 aa  66.6  7e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  28.45 
 
 
500 aa  66.2  8e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.94 
 
 
605 aa  66.2  9e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  27.65 
 
 
284 aa  66.2  9e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 
489 aa  65.5  1e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  26.5 
 
 
632 aa  65.5  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  29.19 
 
 
293 aa  65.9  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
549 aa  65.5  1e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  25.4 
 
 
566 aa  65.9  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  26.5 
 
 
632 aa  65.5  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  29.67 
 
 
228 aa  65.9  1e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>