More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2123 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  68.78 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  48.84 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  43.95 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  45.61 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  46.7 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  45.5 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  42.54 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  41.96 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  41.31 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  39.91 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  39.63 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  40.87 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  37.02 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  42.25 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  41.31 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  41.78 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  40.09 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  39.53 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  35.86 
 
 		 330 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  34.93 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  35.81 
 
 		 330 aa  115  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  34.93 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  35.19 
 
 		 358 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  34.5 
 
 		 358 aa  108  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  30.21 
 
 		 324 aa  102  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  31.6 
 
 		 348 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  30.74 
 
 		 324 aa  99.8  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  31.42 
 
 		 350 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  30.9 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  27.08 
 
 		 329 aa  89.4  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  31.36 
 
 		 324 aa  87.8  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  29.2 
 
 		 322 aa  87  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  32.05 
 
 		 343 aa  85.9  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  27.78 
 
 		 325 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  27.12 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  26.61 
 
 		 407 aa  82  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  28.51 
 
 		 358 aa  81.6  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  28.92 
 
 		 325 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  28.89 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  24.68 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  27.24 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  29.26 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  26.94 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  28.94 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  26.83 
 
 		 322 aa  72  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  28.81 
 
 		 658 aa  71.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  26.53 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  25.93 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  30.77 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  31.06 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  30.21 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  25.61 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  30.21 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  26.89 
 
 		 388 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  26.25 
 
 		 358 aa  68.2  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  32.16 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  25.77 
 
 		 307 aa  67  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  29.91 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.75 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  25.48 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  27.02 
 
 		 365 aa  62.4  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  24.42 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  27.68 
 
 		 327 aa  62  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0296  recA protein  27.35 
 
 		 339 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  31.08 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  28.7 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  28.89 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  27.01 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  23.79 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  28.8 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  29.63 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  29.63 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  25.76 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  28.57 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  21.5 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  27.88 
 
 		 355 aa  58.9  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  27.35 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  27.35 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  29.52 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  28.83 
 
 		 358 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  26.87 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  26.09 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  28.95 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  27.63 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  27.63 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  27.83 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  22.8 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  24.37 
 
 		 356 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  27.4 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  26.41 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  26.46 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  27.03 
 
 		 352 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  26.34 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  28.44 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  27.59 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  26.78 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  26.06 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>