More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1102 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  58.1 
 
 		 729 aa  872    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  100 
 
 		 760 aa  1558    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.63 
 
 		 791 aa  635    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  48.68 
 
 		 693 aa  682    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  47.4 
 
 		 712 aa  643    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  46.9 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  44.55 
 
 		 799 aa  619  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.62 
 
 		 799 aa  616  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  46.14 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  44.23 
 
 		 824 aa  601  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  44.99 
 
 		 726 aa  597  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  43.68 
 
 		 808 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.78 
 
 		 707 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.47 
 
 		 662 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.26 
 
 		 707 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.87 
 
 		 739 aa  463  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.64 
 
 		 746 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.5 
 
 		 694 aa  462  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.27 
 
 		 756 aa  461  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.51 
 
 		 747 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.44 
 
 		 707 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.84 
 
 		 706 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.83 
 
 		 709 aa  450  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 		 747 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.56 
 
 		 708 aa  442  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.85 
 
 		 751 aa  436  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.78 
 
 		 729 aa  431  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.89 
 
 		 710 aa  424  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.44 
 
 		 715 aa  403  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.79 
 
 		 700 aa  350  8e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.68 
 
 		 988 aa  347  6e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.03 
 
 		 1265 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.93 
 
 		 803 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.58 
 
 		 780 aa  249  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.95 
 
 		 785 aa  248  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.78 
 
 		 807 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.35 
 
 		 800 aa  221  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  25.65 
 
 		 874 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.92 
 
 		 1004 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  34.54 
 
 		 1767 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  36.94 
 
 		 825 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  28.39 
 
 		 901 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 		 820 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  31.95 
 
 		 2208 aa  170  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.68 
 
 		 825 aa  170  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 		 1230 aa  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.09 
 
 		 667 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  32.67 
 
 		 701 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  33.58 
 
 		 402 aa  163  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.84 
 
 		 816 aa  162  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 695 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.31 
 
 		 810 aa  162  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  31.54 
 
 		 903 aa  162  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.31 
 
 		 811 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.41 
 
 		 952 aa  161  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.68 
 
 		 1004 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  32.43 
 
 		 1060 aa  158  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  28.13 
 
 		 2015 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  30.54 
 
 		 926 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 811 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.04 
 
 		 1318 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 		 669 aa  155  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  29.52 
 
 		 2152 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.13 
 
 		 811 aa  151  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  29.36 
 
 		 1942 aa  150  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  31.18 
 
 		 1173 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  32.03 
 
 		 924 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  29.17 
 
 		 1165 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  28.96 
 
 		 1173 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  29.11 
 
 		 905 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  28.22 
 
 		 1589 aa  147  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  26.59 
 
 		 2111 aa  147  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.2 
 
 		 927 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  29.55 
 
 		 904 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.95 
 
 		 927 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  30.12 
 
 		 2157 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  31.69 
 
 		 890 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  30.79 
 
 		 924 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  31.05 
 
 		 924 aa  144  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.18 
 
 		 1166 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  31.23 
 
 		 919 aa  144  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.81 
 
 		 817 aa  143  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.61 
 
 		 889 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  31.5 
 
 		 893 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  30.82 
 
 		 933 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.73 
 
 		 762 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  27.64 
 
 		 1055 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  28.99 
 
 		 1073 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.75 
 
 		 684 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  27.64 
 
 		 2189 aa  141  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.36 
 
 		 1197 aa  141  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  29.06 
 
 		 1068 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.49 
 
 		 931 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.9 
 
 		 996 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.95 
 
 		 688 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  27.75 
 
 		 1465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  28.7 
 
 		 916 aa  137  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  27.29 
 
 		 1068 aa  137  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  27.05 
 
 		 882 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  28.98 
 
 		 906 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>