238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0087 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 492 aa  971    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  78.86 
 
 		 492 aa  792    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  61.86 
 
 		 537 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  55.71 
 
 		 479 aa  551  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  56.42 
 
 		 477 aa  541  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  55.49 
 
 		 479 aa  542  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  55.19 
 
 		 477 aa  529  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  55.08 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  51.95 
 
 		 492 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  52.13 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  49.71 
 
 		 500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  50.1 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  43.93 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  41.29 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  41.08 
 
 		 442 aa  316  7e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  40.87 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  38.45 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  40.12 
 
 		 443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  32.53 
 
 		 476 aa  242  9e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  33.06 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  32.38 
 
 		 476 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  32.58 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.82 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  30.42 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  31.73 
 
 		 476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  30.08 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  30.16 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  28.06 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  27.92 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  26.79 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.56 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  27.07 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  25.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  21.17 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  23.34 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  22.31 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  24.53 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  23.64 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  23.29 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  23.29 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  23.29 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  22.52 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  23.7 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  23.91 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  23.91 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  23.91 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  27.05 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  21.08 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  22.87 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  26.62 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  23.32 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  26.28 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  26.28 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  24.3 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  24.49 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  21.77 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  24.91 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  21.47 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  22.72 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  22.13 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  23.21 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  21.34 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.16 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  21.86 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  22.77 
 
 		 450 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  21.92 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  24 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  21.8 
 
 		 439 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.22 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  21.66 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  21.66 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  20.04 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  24.25 
 
 		 455 aa  53.9  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  23.31 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  23.03 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  24.68 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  25.93 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  21.29 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  21.33 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  21.33 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  27.6 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  23.55 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  23.55 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  24.67 
 
 		 438 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.12 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  23.19 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  24.15 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  22.29 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  23.28 
 
 		 430 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  23.86 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  24.04 
 
 		 442 aa  50.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  25.25 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  21.3 
 
 		 452 aa  50.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  24.58 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  21.63 
 
 		 426 aa  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  24.45 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>