More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02463 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  100 
 
 		 419 aa  853    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.93 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.93 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  38.74 
 
 		 406 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.93 
 
 		 406 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  38.74 
 
 		 406 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.69 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.44 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 		 406 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.96 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.71 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.96 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.71 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  37.47 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 904 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 410 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.82 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 395 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 410 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.25 
 
 		 407 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  24.94 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.67 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 374 aa  97.8  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 411 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  38.01 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  29.47 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  26.91 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.33 
 
 		 409 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  26.56 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 366 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 		 454 aa  93.2  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 415 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  23.81 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.62 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 370 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 401 aa  87.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  35.95 
 
 		 403 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>