114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1710 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  530  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  40.32 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  37.15 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  36.29 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  36.44 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  36.21 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  36.21 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  35.57 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  37.55 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  32.11 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  32.11 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  32.05 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  34.38 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  35.34 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  35.34 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  34.39 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  32.11 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  32.5 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  28.29 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  25.1 
 
 		 408 aa  75.5  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  26.03 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  27.84 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.89 
 
 		 406 aa  72  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.75 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  23.14 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  23.77 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  24.44 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  24.58 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  24.58 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  24.58 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  24.17 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  26.38 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  23.89 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  25.73 
 
 		 620 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  22.69 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  25.27 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  25.42 
 
 		 423 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  23.36 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  23.66 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  24.49 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  20.77 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  22.98 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  22.51 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  23.11 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  23.05 
 
 		 475 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  24.28 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  23.9 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  20.61 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  20.61 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  21.96 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  21.92 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  21.96 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  21.65 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  22.4 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  20.91 
 
 		 425 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  24.89 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  20.61 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  21.01 
 
 		 420 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  23.27 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  22.44 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  22.05 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  22.8 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  22.05 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  22.05 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  22.62 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  22.05 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  22.05 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  21.01 
 
 		 420 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  26.56 
 
 		 419 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  27.06 
 
 		 634 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  22.05 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  20.9 
 
 		 415 aa  49.7  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  23.92 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  24.71 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  20.55 
 
 		 531 aa  49.3  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  22.8 
 
 		 473 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  23.79 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  22.99 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  23.53 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  23.53 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  24.31 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  21.96 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  24.31 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  21.65 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  24.31 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  22.05 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  20.89 
 
 		 414 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  29.2 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  24.79 
 
 		 550 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  21.54 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  24.47 
 
 		 463 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  23.14 
 
 		 869 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>