More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0503 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0503  ATPase  100 
 
 		 633 aa  1237    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  70.36 
 
 		 631 aa  867    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  73.66 
 
 		 629 aa  900    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  68.04 
 
 		 633 aa  845    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  72.64 
 
 		 625 aa  885    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  49.92 
 
 		 602 aa  580  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  50.88 
 
 		 640 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  50.08 
 
 		 618 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  41.99 
 
 		 658 aa  520  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  42.34 
 
 		 631 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  44.07 
 
 		 630 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  44.07 
 
 		 630 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  45.81 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  45.19 
 
 		 634 aa  502  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  42.81 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  44.07 
 
 		 630 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  42.81 
 
 		 651 aa  500  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  41.37 
 
 		 655 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  41.29 
 
 		 605 aa  462  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  38.88 
 
 		 671 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  39.35 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  38.31 
 
 		 506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  39.58 
 
 		 521 aa  357  5e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  38.55 
 
 		 517 aa  356  5.999999999999999e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  38.17 
 
 		 518 aa  344  2e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  36.99 
 
 		 519 aa  339  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  37.02 
 
 		 520 aa  339  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  38.93 
 
 		 510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  34.73 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.88 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.84 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  31.51 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  26.21 
 
 		 785 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  25.45 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 		 357 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  29.44 
 
 		 416 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 		 357 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 		 358 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  26.02 
 
 		 423 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  29.21 
 
 		 500 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.9 
 
 		 453 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  28.67 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  28.67 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 489 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  27.37 
 
 		 469 aa  54.7  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  35.83 
 
 		 575 aa  54.3  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  30.29 
 
 		 464 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  28.32 
 
 		 412 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  29.44 
 
 		 449 aa  54.3  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  32.86 
 
 		 369 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.98 
 
 		 322 aa  53.9  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  28.21 
 
 		 492 aa  53.9  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 508 aa  53.9  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.94 
 
 		 327 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  29.55 
 
 		 322 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  25.12 
 
 		 490 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  29.19 
 
 		 323 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.55 
 
 		 322 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  32.86 
 
 		 369 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  32.86 
 
 		 369 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  28.37 
 
 		 569 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 445 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 466 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 455 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  31.11 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  25.12 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  25.6 
 
 		 482 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  26.71 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  25.12 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.3 
 
 		 327 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.85 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  25.12 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  29.3 
 
 		 327 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  28.11 
 
 		 455 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  24.64 
 
 		 488 aa  52  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 455 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  28.11 
 
 		 455 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  27.4 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 460 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  25.12 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.08 
 
 		 320 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  25.67 
 
 		 492 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.49 
 
 		 333 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  29.48 
 
 		 452 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  34.06 
 
 		 385 aa  52  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  30.83 
 
 		 494 aa  51.2  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  25.82 
 
 		 444 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  26.71 
 
 		 483 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  25.82 
 
 		 444 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  27.4 
 
 		 484 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>