More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0059 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
729 aa  1462    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
739 aa  462  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
708 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  39.66 
 
 
588 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
748 aa  151  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 
785 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
617 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
473 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
641 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
616 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
858 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
516 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
1034 aa  127  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
1052 aa  125  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
991 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
390 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
590 aa  117  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
450 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  32.91 
 
 
376 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 
763 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  31.2 
 
 
383 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  28.08 
 
 
738 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
569 aa  111  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
578 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
483 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
511 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
426 aa  108  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  30.89 
 
 
387 aa  107  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 
1039 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  29.61 
 
 
582 aa  104  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
563 aa  104  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
574 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
596 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
618 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
562 aa  99  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 
594 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 
1045 aa  98.2  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
559 aa  97.8  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  28.85 
 
 
559 aa  97.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 
689 aa  94  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  29.14 
 
 
515 aa  92.8  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.64 
 
 
887 aa  91.7  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  31.78 
 
 
265 aa  91.3  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.47 
 
 
572 aa  90.9  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  33.33 
 
 
298 aa  90.9  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  26.38 
 
 
337 aa  90.9  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
593 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
570 aa  89  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  25.65 
 
 
565 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
758 aa  87.8  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
529 aa  87.4  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  28 
 
 
385 aa  87  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  25.51 
 
 
588 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
873 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 
438 aa  83.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  28.29 
 
 
384 aa  84  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
603 aa  82.4  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
700 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
691 aa  80.9  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 
723 aa  80.9  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4428  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.05 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.11127  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.57 
 
 
531 aa  79  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.31 
 
 
531 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
523 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 
1568 aa  78.6  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
592 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 
586 aa  77.4  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  21.96 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  20.93 
 
 
737 aa  76.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.64 
 
 
598 aa  75.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  26.32 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
800 aa  75.5  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
625 aa  75.5  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  26.85 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
663 aa  75.1  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  28.86 
 
 
696 aa  74.7  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
642 aa  73.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
587 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
493 aa  73.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
655 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  27.97 
 
 
322 aa  73.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.13 
 
 
893 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
952 aa  72.4  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
458 aa  72  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
1042 aa  71.6  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.63 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
725 aa  71.2  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  25.7 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
666 aa  71.2  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
629 aa  70.9  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
1211 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
729 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
346 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3116  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 
429 aa  70.5  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
654 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 
882 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>