More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3010 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  75.99 
 
 		 844 aa  1320    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  66.37 
 
 		 864 aa  1151    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  67.95 
 
 		 843 aa  1198    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  48.55 
 
 		 743 aa  658    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  68.9 
 
 		 827 aa  1183    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 863 aa  1747    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  47.65 
 
 		 744 aa  643    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  44.62 
 
 		 771 aa  634  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  47.42 
 
 		 931 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  47.11 
 
 		 931 aa  612  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  45.83 
 
 		 938 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  46.03 
 
 		 942 aa  593  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  45.16 
 
 		 935 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  45.36 
 
 		 702 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  37.25 
 
 		 747 aa  510  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  35.39 
 
 		 837 aa  508  9.999999999999999e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  34.94 
 
 		 837 aa  505  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.2 
 
 		 849 aa  498  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  35.37 
 
 		 834 aa  479  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  29.55 
 
 		 780 aa  368  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  29.48 
 
 		 855 aa  362  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  29.29 
 
 		 812 aa  340  9e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  29.91 
 
 		 817 aa  335  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  28.45 
 
 		 853 aa  335  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 814 aa  333  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 814 aa  330  9e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.33 
 
 		 604 aa  293  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  31.22 
 
 		 610 aa  276  8e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  30.82 
 
 		 604 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  30.83 
 
 		 602 aa  275  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  32.73 
 
 		 596 aa  273  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  31.69 
 
 		 631 aa  268  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.06 
 
 		 691 aa  253  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 851 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 851 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  29.06 
 
 		 768 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.61 
 
 		 869 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 869 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  30.31 
 
 		 868 aa  245  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 869 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 789 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  29.83 
 
 		 689 aa  243  7.999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.65 
 
 		 695 aa  243  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 691 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  30.28 
 
 		 693 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 691 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 758 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  30.49 
 
 		 836 aa  240  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 876 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  31.2 
 
 		 697 aa  240  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 869 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 870 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  30.45 
 
 		 859 aa  239  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  28.61 
 
 		 836 aa  239  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 793 aa  238  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  29.03 
 
 		 747 aa  238  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  30.08 
 
 		 868 aa  237  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  26.77 
 
 		 751 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  29.37 
 
 		 760 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  30.08 
 
 		 868 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  29.5 
 
 		 743 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  29.96 
 
 		 694 aa  235  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  31.93 
 
 		 876 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 746 aa  234  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  32.7 
 
 		 868 aa  233  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  27.73 
 
 		 765 aa  233  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  27.87 
 
 		 693 aa  233  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  30.76 
 
 		 797 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  29 
 
 		 691 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.5 
 
 		 700 aa  232  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  27.48 
 
 		 684 aa  232  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  29.01 
 
 		 670 aa  231  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1197  DNA topoisomerase I  31.28 
 
 		 899 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 866 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  28.91 
 
 		 700 aa  229  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  32.4 
 
 		 876 aa  229  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  29.8 
 
 		 702 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 700 aa  227  6e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 765 aa  228  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 866 aa  227  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 696 aa  227  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  30.78 
 
 		 867 aa  226  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  29.04 
 
 		 748 aa  226  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  27.3 
 
 		 756 aa  225  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  29.11 
 
 		 853 aa  225  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 694 aa  225  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  27.94 
 
 		 729 aa  225  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 869 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 668 aa  224  6e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  224  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  224  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  224  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  27.05 
 
 		 759 aa  224  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  224  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  29.54 
 
 		 865 aa  224  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  223  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  26.89 
 
 		 759 aa  223  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  28.29 
 
 		 704 aa  224  8e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  27.95 
 
 		 710 aa  224  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 865 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>