More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0097 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  100 
 
 		 601 aa  1229    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  50 
 
 		 595 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  40.5 
 
 		 588 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  33.22 
 
 		 600 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  32.31 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  36.09 
 
 		 498 aa  177  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.35 
 
 		 669 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  32.56 
 
 		 658 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  30.41 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  29.54 
 
 		 715 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  30.89 
 
 		 650 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  30.25 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  30.98 
 
 		 778 aa  143  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.03 
 
 		 567 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  26.27 
 
 		 670 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.37 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.11 
 
 		 717 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  28.08 
 
 		 485 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  30.16 
 
 		 657 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.58 
 
 		 530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.32 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.51 
 
 		 485 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.51 
 
 		 485 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.51 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.51 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.22 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  27.61 
 
 		 694 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  25.33 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.15 
 
 		 834 aa  134  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  31.27 
 
 		 356 aa  134  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.19 
 
 		 485 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.09 
 
 		 691 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.67 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.09 
 
 		 691 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  33.65 
 
 		 677 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  27.84 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.35 
 
 		 681 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.01 
 
 		 401 aa  130  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  32.39 
 
 		 635 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  32.08 
 
 		 378 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.36 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.13 
 
 		 539 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.76 
 
 		 480 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  33.12 
 
 		 513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  29.75 
 
 		 501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  26.74 
 
 		 691 aa  127  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.71 
 
 		 514 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  28.25 
 
 		 367 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.32 
 
 		 691 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.32 
 
 		 691 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.32 
 
 		 691 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.74 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.6 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.6 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  28.49 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  24.94 
 
 		 614 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  27.86 
 
 		 616 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  28.38 
 
 		 694 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.01 
 
 		 566 aa  124  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  29.06 
 
 		 524 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.37 
 
 		 1032 aa  123  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.76 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  29.28 
 
 		 603 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.93 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  31.15 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.89 
 
 		 485 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.61 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.76 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.96 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  28.24 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.56 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  28.37 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  26.63 
 
 		 620 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.17 
 
 		 966 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.76 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  30.46 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.69 
 
 		 1055 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  29.78 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  33.45 
 
 		 395 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  28.74 
 
 		 361 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  30.88 
 
 		 422 aa  117  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  33.1 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.19 
 
 		 392 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30 
 
 		 395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  28.43 
 
 		 694 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.36 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.83 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  29.82 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  31.12 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.8 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.89 
 
 		 526 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  31.25 
 
 		 392 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  28.61 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.44 
 
 		 793 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.12 
 
 		 637 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  26.88 
 
 		 379 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  27.92 
 
 		 482 aa  113  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  26.92 
 
 		 562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  25.88 
 
 		 325 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  26.71 
 
 		 822 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>