More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2124 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 460 aa  913    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  57.65 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  55.17 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  47.4 
 
 		 276 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  56.62 
 
 		 258 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  56.3 
 
 		 265 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  56.59 
 
 		 257 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 233 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  48.68 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  54.96 
 
 		 254 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  47.13 
 
 		 238 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  53.68 
 
 		 253 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  52.9 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  50.7 
 
 		 276 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  53.62 
 
 		 254 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  53.62 
 
 		 231 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 261 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  53.96 
 
 		 238 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  52.59 
 
 		 242 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  50.69 
 
 		 336 aa  141  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  53.38 
 
 		 233 aa  140  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  54.81 
 
 		 268 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  49.03 
 
 		 254 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  52.59 
 
 		 272 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  54.62 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  50.76 
 
 		 241 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  46.41 
 
 		 251 aa  136  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  48.3 
 
 		 210 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  50 
 
 		 197 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  52.24 
 
 		 251 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 240 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 		 217 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 223 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  48.48 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 262 aa  114  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  52.69 
 
 		 120 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 234 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  36.88 
 
 		 278 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.4 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40.32 
 
 		 251 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 258 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 		 716 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  41.94 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  36.72 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  38.97 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.35 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  37.9 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  43.12 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.06 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2967  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.335517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  32.72 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  35.21 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  37.1 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  41.51 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 198 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  35.21 
 
 		 204 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3328  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.63 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  36.5 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  35.38 
 
 		 359 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  37.78 
 
 		 174 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  32.41 
 
 		 642 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  37.19 
 
 		 188 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  37.9 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 175 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  35.04 
 
 		 642 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 660 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  36.15 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  35.04 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  38.21 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  38.68 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  36.29 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  35.46 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  36.29 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  37.69 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  34.81 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 199 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6203  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0827287  normal  0.0199903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  36.63 
 
 		 690 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.19 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  38.71 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 590 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>