214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1054 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  100 
 
 		 320 aa  624  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  93.12 
 
 		 320 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  46.93 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  41.46 
 
 		 316 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  35.84 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  32.62 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  34.95 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  33.23 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  35.47 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  33.23 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  30.46 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  32.47 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  32.25 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  34.77 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  31.45 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  32.33 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  31.72 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  31.72 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  33.54 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  31.75 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  37.62 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  36.5 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  40.91 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  35.87 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  32.72 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  36.36 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  34.33 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  36.62 
 
 		 660 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  29.39 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  37.91 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  31.99 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  38.83 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  32.77 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  38.1 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  31.66 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  40.76 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  40.11 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  33.54 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  35.87 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  35.87 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  36.72 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  27.99 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  34.62 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  32.77 
 
 		 325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 327 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  33 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  26.3 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  31.96 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  29.47 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  29.15 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  27.72 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  34.06 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  31.32 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  33.15 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  33.15 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  33.15 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>