More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0396 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  100 
 
 
150 aa  304  2e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  71.33 
 
 
150 aa  231  2e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  47.18 
 
 
333 aa  139  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  51.52 
 
 
265 aa  133  7e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
248 aa  123  8e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  51.22 
 
 
274 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
216 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  51.69 
 
 
454 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.96935e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  48.28 
 
 
391 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  37.11 
 
 
173 aa  119  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  46.9 
 
 
217 aa  119  1e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  45.39 
 
 
228 aa  119  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  47.86 
 
 
212 aa  119  2e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  50.77 
 
 
156 aa  119  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  42.07 
 
 
205 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  4.4472e-09 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  49.15 
 
 
450 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
223 aa  117  4e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
249 aa  117  4e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  41.78 
 
 
193 aa  117  4e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  45.83 
 
 
226 aa  117  5e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
224 aa  117  5e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
223 aa  117  5e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.29 
 
 
257 aa  117  5e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.11899e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  45.3 
 
 
258 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  44.68 
 
 
226 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  43.57 
 
 
222 aa  116  1e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  43.65 
 
 
234 aa  115  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.65 
 
 
224 aa  115  2e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  46.67 
 
 
242 aa  115  2e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  43.94 
 
 
225 aa  115  2e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  50 
 
 
232 aa  115  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
223 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.65 
 
 
223 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.24971e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  47.01 
 
 
226 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.65 
 
 
223 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  46.83 
 
 
226 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.65 
 
 
223 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
221 aa  114  4e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.64638e-06  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  46.46 
 
 
205 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
178 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 
218 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42.86 
 
 
218 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 
218 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 
218 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.76333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 
234 aa  113  7e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.2944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42.86 
 
 
234 aa  113  7e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 
234 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  6.24175e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  42.06 
 
 
221 aa  113  8e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  47.37 
 
 
205 aa  112  2e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
207 aa  112  2e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  43.7 
 
 
177 aa  112  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  47.93 
 
 
208 aa  112  2e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
188 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  39.19 
 
 
391 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  45.93 
 
 
179 aa  110  4e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  43.28 
 
 
198 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  53.21 
 
 
179 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  47.11 
 
 
208 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  44.6 
 
 
208 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
177 aa  110  7e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
177 aa  110  7e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
298 aa  110  8e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  41.3 
 
 
242 aa  110  8e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  54.13 
 
 
196 aa  110  8e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.56339e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  40 
 
 
283 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  40 
 
 
283 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56191e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.64 
 
 
476 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  45 
 
 
215 aa  109  1e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  40 
 
 
283 aa  109  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  45 
 
 
215 aa  109  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
207 aa  108  2e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
211 aa  108  2e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  42.4 
 
 
271 aa  108  2e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  42.4 
 
 
271 aa  108  2e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.06609e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
271 aa  108  2e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  42.4 
 
 
275 aa  108  2e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  42.4 
 
 
271 aa  108  2e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.02623e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  45.6 
 
 
215 aa  108  2e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  39.74 
 
 
162 aa  108  2e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
271 aa  108  2e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  42.4 
 
 
271 aa  108  2e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
188 aa  108  2e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  42.4 
 
 
271 aa  108  2e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  42.4 
 
 
271 aa  108  2e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  41.22 
 
 
341 aa  109  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.54936e-13  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  43.88 
 
 
207 aa  109  2e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  44.63 
 
 
177 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  1.44437e-08 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  44.63 
 
 
342 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  52.29 
 
 
154 aa  107  4e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  46.49 
 
 
273 aa  108  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  46.49 
 
 
273 aa  108  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  46.49 
 
 
273 aa  108  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.2854e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>