101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1777 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  60.12 
 
 		 164 aa  208  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  61.35 
 
 		 161 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  59.87 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  64.15 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  62.89 
 
 		 164 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  62.42 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  56.96 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  49.38 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  42.33 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  41.45 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  44.1 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  42.11 
 
 		 172 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  39.87 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  40.74 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  42.68 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  41.14 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  39.75 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  44.38 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  41.36 
 
 		 159 aa  98.2  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  37.74 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  38.51 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  39.51 
 
 		 161 aa  90.9  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  38.99 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  38.36 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  37.5 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  35.85 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  32.53 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  34.32 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  29.94 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  33.97 
 
 		 126 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  30.97 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  34.62 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  31.55 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  31.68 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  28.21 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  29.94 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  29.68 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  32.26 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  29.61 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  30.57 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  30.57 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  31.14 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  29.09 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  29.94 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  26.88 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  30.97 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  31.72 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  27.95 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  27.93 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  27.56 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 124 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  33.02 
 
 		 130 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  29.7 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  30.91 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  29.06 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  29.31 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  25.64 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  28.18 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  28.18 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  28.7 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  33.93 
 
 		 323 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  29.31 
 
 		 338 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  28.7 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  28.24 
 
 		 166 aa  44.3  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  29.32 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  28.18 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  37.74 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  31.58 
 
 		 323 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  32.76 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  34.15 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  28.1 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  27.43 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  34.15 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.91 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  29.23 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  35.94 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  35.48 
 
 		 114 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  26.96 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  34.55 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  32.73 
 
 		 142 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  32.08 
 
 		 349 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  28.33 
 
 		 348 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  28.21 
 
 		 324 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  32.08 
 
 		 325 aa  41.6  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  26.36 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  30.36 
 
 		 330 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  26.36 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  31.71 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.62 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  26.61 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  24.24 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>