More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1162 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  89.18 
 
 		 231 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  78.41 
 
 		 228 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  79.3 
 
 		 229 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  78.85 
 
 		 229 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  77.39 
 
 		 231 aa  356  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  72.07 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  69.33 
 
 		 230 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  71.49 
 
 		 230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  71.17 
 
 		 268 aa  325  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  70.09 
 
 		 235 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  68.56 
 
 		 232 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  68.56 
 
 		 232 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  68.12 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  68.12 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  67.69 
 
 		 232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  69.87 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  67.25 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  65.16 
 
 		 235 aa  301  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  60.18 
 
 		 229 aa  281  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  60.99 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  59.47 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  57.4 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 		 229 aa  271  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  56.64 
 
 		 235 aa  269  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  56.36 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  54.55 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  55.7 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  51.8 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.95 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  48.89 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  47.06 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  47.35 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  47.3 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.12 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  45.7 
 
 		 293 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.34 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.36 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  48.9 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.58 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  48.65 
 
 		 298 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  47.06 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.42 
 
 		 288 aa  211  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.08 
 
 		 280 aa  211  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  48.17 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  46.58 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.58 
 
 		 239 aa  211  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.09 
 
 		 266 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  50.46 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.27 
 
 		 648 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.2 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.3 
 
 		 264 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  47.27 
 
 		 648 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.27 
 
 		 648 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.27 
 
 		 648 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  48.68 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.27 
 
 		 648 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  47.27 
 
 		 648 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  46.49 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  47.95 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.82 
 
 		 648 aa  208  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 648 aa  208  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.75 
 
 		 225 aa  208  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.75 
 
 		 225 aa  208  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.58 
 
 		 239 aa  207  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.11 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.84 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.03 
 
 		 648 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.8 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  47.96 
 
 		 643 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.03 
 
 		 648 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  46.54 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.69 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  49.3 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  47.51 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  43.95 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  46.82 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  46.73 
 
 		 291 aa  205  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  43.89 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  44.75 
 
 		 252 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  44.75 
 
 		 252 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>