More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4749 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  527  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  42.47 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  43.18 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  43.24 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  43.24 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  41.71 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  38.07 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  37.67 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  38.97 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  38.76 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  40.34 
 
 		 223 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  37.36 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  37.89 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  35.03 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  31.42 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.77 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.05 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  32.35 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  29.65 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  27.18 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30.65 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  30.69 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  27.66 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  23.55 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  29.67 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  23.73 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  25.83 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  38.78 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>