287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3806 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  57.64 
 
 		 374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  55.47 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  47.91 
 
 		 374 aa  352  7e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  37.98 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 		 379 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  22.25 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  23.74 
 
 		 424 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  21.74 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.1 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  22.42 
 
 		 434 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  20.87 
 
 		 457 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  22.89 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  24.13 
 
 		 430 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.46 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.12 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  21.76 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  22.75 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  23.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  22.36 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  20 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  21.49 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  22.96 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  21.32 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  24.35 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  21.39 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  21.37 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  24.21 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  22.62 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  25.21 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  24.22 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.25 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  19.7 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  20.1 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  21.86 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.45 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  20.44 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  23.64 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  24.02 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  21.79 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  21.97 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  23.12 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2051  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  23.65 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0991465  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  22.36 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  26.11 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  22.28 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.76 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  22.79 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  23.72 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  22.87 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.46 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  31.65 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0609  ubiquinone biosynthesis visC protein  23.38 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1340  hypothetical protein  23.08 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  22.38 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  21 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  20.82 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  22.66 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  20.39 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  23.3 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.81 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  37.7 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  32.08 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0092  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  23.04 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.51 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.29 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  45.61 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  22.26 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  22.61 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  19.58 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  22.99 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>