More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0775 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
745 aa  1526    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.96 
 
 
734 aa  621  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  45.33 
 
 
738 aa  617  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  42.9 
 
 
721 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.82 
 
 
711 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.97 
 
 
755 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.9 
 
 
749 aa  509  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.9 
 
 
758 aa  509  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  40.26 
 
 
755 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  38.75 
 
 
762 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  36.57 
 
 
793 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  36.7 
 
 
793 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.48 
 
 
740 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.21 
 
 
757 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  36.87 
 
 
747 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.8 
 
 
750 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.56 
 
 
750 aa  439  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.18 
 
 
751 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.8 
 
 
790 aa  432  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  37.22 
 
 
749 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  35.04 
 
 
757 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  35.25 
 
 
800 aa  422  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.75 
 
 
760 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  33.46 
 
 
731 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  38.2 
 
 
717 aa  415  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.57 
 
 
758 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.66 
 
 
737 aa  409  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.64 
 
 
721 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.36 
 
 
777 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  37.69 
 
 
708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  37.69 
 
 
714 aa  405  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.8 
 
 
748 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.23 
 
 
722 aa  405  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.63 
 
 
757 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  36.58 
 
 
701 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.13 
 
 
780 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  36.4 
 
 
987 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.3 
 
 
809 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.09 
 
 
742 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.95 
 
 
933 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.69 
 
 
922 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  33.88 
 
 
731 aa  389  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.08 
 
 
741 aa  386  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.5 
 
 
731 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  36.06 
 
 
814 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.77 
 
 
756 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
813 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  47.34 
 
 
887 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  42.79 
 
 
870 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  45.03 
 
 
866 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 
1158 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.02 
 
 
737 aa  372  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  34.55 
 
 
733 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.1 
 
 
1072 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  33.94 
 
 
733 aa  369  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  34.56 
 
 
733 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  33.75 
 
 
733 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  33.75 
 
 
733 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  34.27 
 
 
733 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  33.75 
 
 
733 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  32.4 
 
 
716 aa  362  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  42.92 
 
 
857 aa  361  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.85 
 
 
724 aa  360  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  34.69 
 
 
730 aa  359  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  32.89 
 
 
874 aa  359  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  32.08 
 
 
685 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.94 
 
 
746 aa  357  5e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  34.02 
 
 
748 aa  356  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  34.76 
 
 
737 aa  353  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  33.79 
 
 
748 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  34.34 
 
 
748 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  34.67 
 
 
751 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  34.67 
 
 
751 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  34.12 
 
 
751 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 
805 aa  349  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  44.87 
 
 
832 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  32.26 
 
 
735 aa  347  6e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  34.12 
 
 
779 aa  346  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  34.57 
 
 
691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  34.67 
 
 
731 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  31.74 
 
 
727 aa  333  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  35.13 
 
 
693 aa  333  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.17 
 
 
754 aa  330  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  32.6 
 
 
931 aa  330  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  33.24 
 
 
737 aa  324  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  31.48 
 
 
777 aa  323  6e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.65 
 
 
790 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  31.19 
 
 
763 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  32.44 
 
 
778 aa  320  6e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.05 
 
 
804 aa  320  7.999999999999999e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  30.79 
 
 
763 aa  320  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 
763 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  30.66 
 
 
763 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  28 
 
 
829 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  31.19 
 
 
763 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  31.97 
 
 
905 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.63 
 
 
769 aa  317  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.02 
 
 
778 aa  317  6e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.38 
 
 
1321 aa  316  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.82 
 
 
769 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>