85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2489 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 452 aa  927    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  61.49 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  59.95 
 
 		 455 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  52.89 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  37.02 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  35.07 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  36.32 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  30.54 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  31.14 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  30.56 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  30.54 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  28.63 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  64.84 
 
 		 203 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  27.84 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  25.74 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  28.15 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  27.46 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  26.01 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  27.04 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  27.41 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  26.73 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  42.96 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  32.74 
 
 		 410 aa  97.1  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  50 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.25 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  23.95 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  35.2 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  44.71 
 
 		 769 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.59 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  27.06 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  37.78 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  47.3 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  33.01 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  35.19 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  30.43 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  34.65 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  39.77 
 
 		 113 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  22.98 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  41.18 
 
 		 619 aa  63.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  36.17 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  22.17 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.03 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  27.98 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  32.53 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  31.25 
 
 		 608 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  34.74 
 
 		 712 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  31.06 
 
 		 610 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  31.52 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  24.74 
 
 		 588 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  34.55 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.86 
 
 		 666 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  30.33 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  24.74 
 
 		 976 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  40 
 
 		 582 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  23.23 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  23.49 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  26.45 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  29.03 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  28.83 
 
 		 228 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  28.28 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  24.51 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  30.12 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  31.31 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  29.13 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  30.11 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  29.13 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  31.43 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  28.67 
 
 		 623 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  31.15 
 
 		 250 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  43.1 
 
 		 79 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  20.95 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  23.48 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  26.55 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.78 
 
 		 708 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  32.56 
 
 		 562 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.3 
 
 		 652 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  31.76 
 
 		 606 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  32.94 
 
 		 708 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  34.85 
 
 		 601 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.22 
 
 		 496 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.87 
 
 		 354 aa  43.1  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>