296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0003 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0003  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 354 aa  710    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  25.21 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  26.13 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  27.42 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  27.13 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.45 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.49 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.28 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.795799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  29.39 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.2 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  26.74 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  22.68 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  22.68 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  26.74 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  29.19 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  26.11 
 
 		 374 aa  109  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  24.42 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  24.42 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  25.5 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  21.93 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.51 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.02 
 
 		 376 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.18 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.35 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  29.3 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  23.14 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  26.33 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.53 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.76 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  27.08 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  27.82 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00030  recombination protein F  28.21 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  25.74 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  26.85 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  25.93 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.23 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  24.67 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.3 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  25.8 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  25.8 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  26.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  25.8 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  26.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  26.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  25.8 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  26.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.42 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  25.8 
 
 		 375 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  25.8 
 
 		 375 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  28.74 
 
 		 414 aa  99.4  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  25 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  25 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.76 
 
 		 397 aa  99.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  25 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  26.65 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.1 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  29.43 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  25.79 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  25.9 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  23.32 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  26.63 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  24.5 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  25.62 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  26.89 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  25.27 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  25.9 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  25 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  27 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.82 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  26.09 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  26.74 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  26.74 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0003  recombination protein F  25.62 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  27.52 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  27.6 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  24.24 
 
 		 369 aa  95.9  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  27.18 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  28.5 
 
 		 377 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.25 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4121  recombination protein F  26.46 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.976477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  27.84 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  24.54 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4170  recombination protein F  26.46 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  normal  0.357156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03583  recombination protein F  27.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  29.05 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  27.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  27.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  25.07 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  27.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  27.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  27.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  27.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  23.89 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.23 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.65 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.06 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  25 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  22.79 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>