112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2723 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2723  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 384 aa  799    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1715  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 370 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1616  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.230625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0740  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3365  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.803151  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2250  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.621052 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.19 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  24.78 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.77 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.91 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.06 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  27.12 
 
 		 445 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  24.89 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0182  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.796487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 394 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.61 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  27.12 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  27.12 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  27.12 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  27.12 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  27.12 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 316 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.57 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 375 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.5 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 503 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 565 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.65 
 
 		 334 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.75 
 
 		 367 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  30.23 
 
 		 769 aa  46.2  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4222  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.54 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.05 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.89 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  28.89 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.54 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0630  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.54 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.85 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1109  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.54 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.038115  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.05 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  31.96 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 1000 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.08 
 
 		 455 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.32 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.48 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1235  radical SAM family protein  30.69 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.07 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0989  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.07 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197702  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  31.39 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  22.92 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>