More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3877 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 383 aa  786    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  71.99 
 
 		 356 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  47.14 
 
 		 370 aa  346  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  23.6 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  29.02 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  29.48 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  29.41 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.46 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  23.33 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.42 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  26.53 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.9 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  28.69 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  27.49 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  25.63 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  24.58 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  28.27 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  28.35 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  27.76 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  25.43 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  26.42 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  26.42 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  26.82 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  25.19 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  26.32 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  25.43 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  26.82 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  25.89 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  29.76 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  27.44 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  25.71 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  26.87 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  28 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  24.16 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 102 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 72 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  24.76 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  26.4 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1547  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.358445  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  26.42 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5804  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 101 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365754  normal  0.0338567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  34.04 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.53 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  31.9 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  33.66 
 
 		 145 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  25.62 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  25.32 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 208 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 91 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 182 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 188 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 81 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 84 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  26.21 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  22.4 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 178 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 143 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 67 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  27.08 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 182 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 91 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 182 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 182 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 191 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 182 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 189 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 191 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 182 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  26.28 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 94 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 94 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 94 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 182 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 134 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 94 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  29.77 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  27.74 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 94 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 94 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 179 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 218 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>