More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1546 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 564 aa  1173    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 716 aa  110  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  24.44 
 
 		 673 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.46 
 
 		 696 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 685 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  22.77 
 
 		 705 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  24.85 
 
 		 819 aa  98.6  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  25.73 
 
 		 815 aa  98.2  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 809 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 708 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  26.95 
 
 		 704 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.95 
 
 		 704 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 704 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  23.22 
 
 		 662 aa  91.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  24.8 
 
 		 683 aa  91.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  23.14 
 
 		 759 aa  90.5  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  24.06 
 
 		 658 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 690 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 		 737 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  23.52 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  22.32 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 712 aa  83.2  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  23.58 
 
 		 710 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  22.66 
 
 		 703 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  22.66 
 
 		 703 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  22.93 
 
 		 695 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 699 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  24.95 
 
 		 752 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  22.52 
 
 		 711 aa  77  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 725 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.09 
 
 		 737 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 821 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  24.88 
 
 		 745 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 726 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  21.69 
 
 		 714 aa  74.3  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  23.52 
 
 		 734 aa  73.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  27.14 
 
 		 593 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  23.21 
 
 		 695 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  23.77 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  22.73 
 
 		 671 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 679 aa  72  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  22.68 
 
 		 687 aa  71.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  24.13 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  21.53 
 
 		 712 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 726 aa  70.5  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  21.15 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  27.37 
 
 		 773 aa  70.1  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 655 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  22.94 
 
 		 625 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  22.45 
 
 		 690 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  27 
 
 		 722 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  26.94 
 
 		 722 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  22 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  23.82 
 
 		 783 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  27.18 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.67 
 
 		 932 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  27.18 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  27.18 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  27.18 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.74 
 
 		 722 aa  67  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  23.68 
 
 		 852 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  25.47 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1796  ankyrin  22.71 
 
 		 1047 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00006002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  26.43 
 
 		 709 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 674 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  23.74 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  26.43 
 
 		 709 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 726 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0878  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  20.94 
 
 		 704 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  21.76 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  26.54 
 
 		 778 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  26.42 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  26.42 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  26.41 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  26.42 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  24.61 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0874  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  20.94 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  24.47 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  23.56 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  24.86 
 
 		 1052 aa  64.3  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.57 
 
 		 703 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 		 676 aa  63.9  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 720 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  21.92 
 
 		 717 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  22.39 
 
 		 701 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 750 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  26.33 
 
 		 335 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  25.13 
 
 		 721 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  23.83 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  19.94 
 
 		 1174 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.54 
 
 		 659 aa  61.6  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  22.71 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  24.73 
 
 		 753 aa  60.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  26.42 
 
 		 721 aa  60.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>