176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0878 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0827  superfamily I DNA/RNA helicase  97.59 
 
 		 737 aa  1142    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  76.22 
 
 		 703 aa  919    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0874  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  99.72 
 
 		 704 aa  1334    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0878  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 704 aa  1340    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  36.86 
 
 		 852 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2531  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.87 
 
 		 636 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  28.43 
 
 		 658 aa  178  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.64 
 
 		 629 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.45 
 
 		 629 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.34 
 
 		 689 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  24.3 
 
 		 689 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  24.3 
 
 		 689 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  24.3 
 
 		 689 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  24.16 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  24.44 
 
 		 689 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  23.51 
 
 		 691 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  25.89 
 
 		 702 aa  127  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.97 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  25.99 
 
 		 755 aa  94.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.47 
 
 		 698 aa  90.1  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.52 
 
 		 736 aa  88.2  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  26.69 
 
 		 691 aa  87.8  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  27.27 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  27.63 
 
 		 768 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  30.08 
 
 		 666 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  27.41 
 
 		 778 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  21.47 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  27.2 
 
 		 777 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.61 
 
 		 763 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.64 
 
 		 776 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 778 aa  84  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.22 
 
 		 763 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  25.5 
 
 		 691 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  27.03 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  26.25 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  27.43 
 
 		 760 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  28.52 
 
 		 712 aa  80.5  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  25.87 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  25.87 
 
 		 777 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  25.87 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  25.48 
 
 		 777 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  28.85 
 
 		 703 aa  77  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  28.61 
 
 		 792 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  25.83 
 
 		 753 aa  75.1  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  20.74 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.65 
 
 		 716 aa  73.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  21.4 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.7 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  28.24 
 
 		 706 aa  72  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  22.88 
 
 		 780 aa  72  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.63 
 
 		 813 aa  72  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  33.03 
 
 		 727 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  20.46 
 
 		 706 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  28.24 
 
 		 787 aa  70.5  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 		 515 aa  70.5  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  26.34 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  26.01 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  31.27 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  28.09 
 
 		 673 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.83 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.96 
 
 		 861 aa  64.3  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  22.46 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.94 
 
 		 670 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.95 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  25.56 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.99 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  32.42 
 
 		 795 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.34 
 
 		 724 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  31.82 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  30.67 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  31.43 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  26.99 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  29.82 
 
 		 776 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.57 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.11 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  30.39 
 
 		 692 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.04 
 
 		 705 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 702 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  24.72 
 
 		 1048 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  31.39 
 
 		 680 aa  55.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  30.74 
 
 		 724 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  30.74 
 
 		 724 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 697 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  21.48 
 
 		 772 aa  54.7  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  28.62 
 
 		 679 aa  54.7  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  30.74 
 
 		 724 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.38 
 
 		 699 aa  54.3  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  28.73 
 
 		 684 aa  53.5  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.91 
 
 		 715 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  25.68 
 
 		 712 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  25.93 
 
 		 726 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0357  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.3 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  28.71 
 
 		 717 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  32.81 
 
 		 761 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 680 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 670 aa  52  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  23.7 
 
 		 764 aa  52  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  27.85 
 
 		 715 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 690 aa  51.6  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>