183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0025 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  100 
 
 		 852 aa  1697    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.22 
 
 		 703 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0874  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.48 
 
 		 704 aa  173  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0827  superfamily I DNA/RNA helicase  38.03 
 
 		 737 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0878  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.48 
 
 		 704 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  24.51 
 
 		 691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  24.72 
 
 		 689 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  24.69 
 
 		 689 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  24.69 
 
 		 689 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.32 
 
 		 689 aa  163  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  24.57 
 
 		 689 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  24.54 
 
 		 691 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  24.26 
 
 		 691 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  23.82 
 
 		 689 aa  161  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  24.38 
 
 		 689 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  26.19 
 
 		 712 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  25.65 
 
 		 703 aa  142  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.29 
 
 		 763 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.29 
 
 		 763 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  25.49 
 
 		 702 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  23.74 
 
 		 760 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  22.83 
 
 		 755 aa  130  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  23.95 
 
 		 778 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  25.83 
 
 		 702 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  27.92 
 
 		 658 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  23.27 
 
 		 778 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  25.76 
 
 		 748 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  24.17 
 
 		 776 aa  111  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  24.01 
 
 		 776 aa  111  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  24.01 
 
 		 776 aa  111  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2531  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.94 
 
 		 636 aa  111  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  23.92 
 
 		 777 aa  110  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  23.85 
 
 		 777 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  23.73 
 
 		 776 aa  108  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  23.24 
 
 		 777 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  25.25 
 
 		 753 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.38 
 
 		 629 aa  101  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  27.58 
 
 		 785 aa  98.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.73 
 
 		 629 aa  98.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.13 
 
 		 736 aa  97.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.46 
 
 		 710 aa  97.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  27.12 
 
 		 1048 aa  94  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.38 
 
 		 716 aa  87.8  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.83 
 
 		 861 aa  87.8  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  41.22 
 
 		 759 aa  84.7  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.88 
 
 		 672 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  27.36 
 
 		 902 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.62 
 
 		 758 aa  82  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.57 
 
 		 645 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  46.99 
 
 		 742 aa  79.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  48.91 
 
 		 726 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  45.16 
 
 		 726 aa  79.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.88 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  45.78 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  31.25 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  49.38 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.3 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  40.18 
 
 		 758 aa  77.8  0.0000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.06 
 
 		 741 aa  77  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  48.15 
 
 		 705 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.98 
 
 		 757 aa  77  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  30.83 
 
 		 706 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  37.4 
 
 		 734 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.85 
 
 		 732 aa  76.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.89 
 
 		 724 aa  76.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.24 
 
 		 691 aa  75.5  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  44.58 
 
 		 765 aa  74.7  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  32.81 
 
 		 780 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  42.35 
 
 		 735 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.37 
 
 		 813 aa  73.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  45.88 
 
 		 750 aa  74.3  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.71 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  35.25 
 
 		 724 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  39.85 
 
 		 799 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  45.68 
 
 		 829 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  35.11 
 
 		 724 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  35.11 
 
 		 724 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.22 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  44.44 
 
 		 776 aa  71.2  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.45 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  35.2 
 
 		 771 aa  70.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  42.05 
 
 		 874 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  35.71 
 
 		 754 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  42.53 
 
 		 759 aa  70.5  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.23 
 
 		 804 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  45.45 
 
 		 679 aa  70.1  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  45.12 
 
 		 761 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  45.45 
 
 		 795 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  44.44 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  23.86 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  45.45 
 
 		 692 aa  67.8  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.58 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  23.9 
 
 		 768 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.55 
 
 		 704 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.55 
 
 		 704 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  27.07 
 
 		 269 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.7 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.23 
 
 		 832 aa  66.6  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  25.55 
 
 		 704 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>