45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1796 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2565  ankyrin  45.82 
 
 		 973 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00388007  normal  0.0998723 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1796  ankyrin  100 
 
 		 1047 aa  2176    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00006002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51910  Ankyrin  49.02 
 
 		 954 aa  863    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1421 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  22.9 
 
 		 932 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  22.52 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  27.18 
 
 		 734 aa  65.1  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.7 
 
 		 716 aa  60.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.72 
 
 		 698 aa  57.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  23.22 
 
 		 696 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  42.25 
 
 		 490 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.49 
 
 		 755 aa  53.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  21.46 
 
 		 690 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  24.37 
 
 		 809 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  26.19 
 
 		 683 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  24 
 
 		 695 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  25.09 
 
 		 335 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  25.77 
 
 		 700 aa  49.3  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.45 
 
 		 1107 aa  48.9  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 		 751 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.55 
 
 		 706 aa  47.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.15 
 
 		 658 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1048  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  21.73 
 
 		 363 aa  47.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  22.86 
 
 		 716 aa  48.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  22.95 
 
 		 765 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  31.03 
 
 		 671 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.12 
 
 		 736 aa  46.6  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 1027 aa  47  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  23.72 
 
 		 697 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 		 662 aa  46.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  32.11 
 
 		 1658 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.47 
 
 		 662 aa  46.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.05 
 
 		 673 aa  46.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  20.33 
 
 		 673 aa  45.8  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 706 aa  45.8  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  25.79 
 
 		 1208 aa  46.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  27.67 
 
 		 1073 aa  45.8  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  22.94 
 
 		 682 aa  45.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  23 
 
 		 669 aa  45.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.91 
 
 		 669 aa  45.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 688 aa  45.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.29 
 
 		 1016 aa  45.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.23 
 
 		 669 aa  44.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.86 
 
 		 735 aa  44.7  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.26 
 
 		 670 aa  44.7  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>