45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1796  ankyrin  49.02 
 
 
1047 aa  867    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00006002  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2565  ankyrin  56.17 
 
 
973 aa  1009    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00388007  normal  0.0998723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51910  Ankyrin  100 
 
 
954 aa  1944    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
1421 aa  128  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.32 
 
 
932 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.56 
 
 
696 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  25.32 
 
 
700 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  26.09 
 
 
673 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  25.63 
 
 
712 aa  59.3  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 
695 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 
809 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  28.82 
 
 
734 aa  58.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.43 
 
 
1107 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 
710 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 
695 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  25.26 
 
 
335 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 
697 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 
663 aa  55.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  25.29 
 
 
712 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  25.22 
 
 
716 aa  53.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.84 
 
 
698 aa  52.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  22.11 
 
 
715 aa  51.2  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.64 
 
 
716 aa  50.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  29.71 
 
 
690 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 
662 aa  48.9  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 
708 aa  48.9  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2853  hypothetical protein  26.43 
 
 
1029 aa  48.5  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  28.15 
 
 
696 aa  47.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.97 
 
 
736 aa  47.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  23.1 
 
 
691 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  36.19 
 
 
734 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.31 
 
 
788 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  22.91 
 
 
689 aa  47  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  23.19 
 
 
689 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.62 
 
 
768 aa  45.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  28.99 
 
 
630 aa  45.8  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  20.82 
 
 
629 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  25.81 
 
 
771 aa  45.8  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 
681 aa  45.4  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1063  Ankyrin  41.67 
 
 
341 aa  45.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  31.25 
 
 
616 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  20.7 
 
 
629 aa  45.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.69 
 
 
706 aa  45.1  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.71 
 
 
755 aa  44.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  24.07 
 
 
658 aa  44.3  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>