37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1048 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1048  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 363 aa  742    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3012  hypothetical protein  29.92 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1959  hypothetical protein  24.58 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2563  hypothetical protein  25.45 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3756  hypothetical protein  22.1 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  30.73 
 
 		 552 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4761  putative DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.12 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  24.05 
 
 		 742 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.89 
 
 		 766 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.76 
 
 		 730 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1796  ankyrin  21.73 
 
 		 1047 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00006002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.76 
 
 		 730 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  37.66 
 
 		 682 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 797 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 620 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.36 
 
 		 671 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 671 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 671 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  23.31 
 
 		 797 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 751 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  24.49 
 
 		 749 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  24.46 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.88 
 
 		 797 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.68 
 
 		 755 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6151  hypothetical protein  21.52 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  36.11 
 
 		 678 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  34.72 
 
 		 758 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  44.26 
 
 		 672 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  25.54 
 
 		 770 aa  43.9  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.31 
 
 		 796 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.31 
 
 		 798 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 736 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  32.14 
 
 		 1343 aa  43.5  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  34.75 
 
 		 1397 aa  43.5  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 627 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  42.31 
 
 		 762 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2355  hypothetical protein  25 
 
 		 458 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>