32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4761 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4761  putative DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA  100 
 
 		 345 aa  724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3756  hypothetical protein  41.04 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00629  hypothetical protein  44.39 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2563  hypothetical protein  32.79 
 
 		 385 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6151  hypothetical protein  36.7 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361634  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1959  hypothetical protein  26.61 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3012  hypothetical protein  26.96 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2355  hypothetical protein  27.6 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1048  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  23.73 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3223  UvrD/REP helicase  34.43 
 
 		 591 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3382  hypothetical protein  26.73 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1870  hypothetical protein  26.73 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  23.37 
 
 		 723 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  23.37 
 
 		 723 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  21.82 
 
 		 783 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.18 
 
 		 670 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 840 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 846 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2289  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.72 
 
 		 542 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121386  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.44 
 
 		 787 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.3 
 
 		 818 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  21.83 
 
 		 737 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 787 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 787 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 787 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 		 787 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 786 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3266  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.48 
 
 		 670 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  29.28 
 
 		 1078 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.38 
 
 		 731 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 793 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.72 
 
 		 1089 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>