62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3382 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3382  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  1001    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1870  hypothetical protein  99.59 
 
 		 484 aa  998    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2355  hypothetical protein  39.79 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  22.47 
 
 		 1060 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2573  hypothetical protein  27.16 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000474072  normal  0.0702383 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  27.54 
 
 		 735 aa  53.5  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  23.58 
 
 		 631 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.05 
 
 		 946 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.05 
 
 		 946 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 		 627 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 		 1082 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 1075 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.95 
 
 		 658 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 		 653 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2563  hypothetical protein  24.27 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1959  hypothetical protein  24.5 
 
 		 343 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  43.94 
 
 		 807 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  21.46 
 
 		 1124 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1845  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 620 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  22.08 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.31 
 
 		 634 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4761  putative DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.13 
 
 		 345 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  40.58 
 
 		 666 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.13 
 
 		 658 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  25.29 
 
 		 634 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.13 
 
 		 640 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  25.37 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  39.13 
 
 		 658 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5487  putative ATP-dependent DNA helicase Rep  35.44 
 
 		 591 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  43.28 
 
 		 706 aa  47.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.3 
 
 		 785 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4251  UvrD/REP helicase  35.38 
 
 		 715 aa  47  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  33 
 
 		 685 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  24.83 
 
 		 723 aa  46.6  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  35.8 
 
 		 671 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 		 1089 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  38.96 
 
 		 677 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.09 
 
 		 743 aa  45.8  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1357  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.981315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0721  UvrD/REP helicase  36.92 
 
 		 701 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  34.52 
 
 		 688 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  20.74 
 
 		 1001 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.8 
 
 		 671 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0426  helicase, UvrD/REP/exonuclease family protein  36.11 
 
 		 870 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.76 
 
 		 672 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.14 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.81 
 
 		 730 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.81 
 
 		 730 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.5 
 
 		 671 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.65 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.92 
 
 		 662 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  35.38 
 
 		 689 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 672 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3200  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 948 aa  43.9  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  26.82 
 
 		 625 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  35.82 
 
 		 737 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  22.8 
 
 		 634 aa  43.5  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  32.84 
 
 		 665 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  29.85 
 
 		 783 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  38.81 
 
 		 663 aa  43.5  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1048  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  23.56 
 
 		 363 aa  43.1  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  24.3 
 
 		 1078 aa  43.5  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>