More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3266 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  100 
 
 		 1078 aa  2138    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  43.76 
 
 		 1089 aa  736    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  47.85 
 
 		 1050 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  41.86 
 
 		 1132 aa  754    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  72.13 
 
 		 1075 aa  1511    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  40.67 
 
 		 1232 aa  698    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  44.13 
 
 		 1032 aa  750    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 		 1033 aa  665    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  46.98 
 
 		 1124 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  57.93 
 
 		 1082 aa  1213    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  42.05 
 
 		 1067 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  42.87 
 
 		 1001 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  74.35 
 
 		 446 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  40.47 
 
 		 1027 aa  630  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  44.7 
 
 		 1062 aa  618  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  43.78 
 
 		 1161 aa  609  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  37.98 
 
 		 1174 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  59.82 
 
 		 1244 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  58.99 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  58.1 
 
 		 1127 aa  475  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  58.99 
 
 		 1089 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  57.08 
 
 		 1156 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  53.85 
 
 		 408 aa  459  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  51.19 
 
 		 414 aa  445  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  50.48 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  50.72 
 
 		 411 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  43.77 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.46 
 
 		 729 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  33.84 
 
 		 726 aa  251  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  33.54 
 
 		 706 aa  250  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.92 
 
 		 785 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  30.88 
 
 		 705 aa  242  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  31.65 
 
 		 721 aa  239  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.01 
 
 		 715 aa  238  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.85 
 
 		 759 aa  237  9e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  32.57 
 
 		 707 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  31.45 
 
 		 729 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  31.43 
 
 		 742 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.97 
 
 		 718 aa  234  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  30.6 
 
 		 721 aa  234  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.5 
 
 		 751 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.2 
 
 		 757 aa  234  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  29.99 
 
 		 738 aa  233  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.5 
 
 		 751 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  29.51 
 
 		 757 aa  232  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  30.97 
 
 		 728 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  30.97 
 
 		 728 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  30.84 
 
 		 727 aa  231  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  29.47 
 
 		 779 aa  231  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 787 aa  231  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  31.45 
 
 		 728 aa  231  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  31.6 
 
 		 728 aa  231  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  31.3 
 
 		 728 aa  230  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  32.1 
 
 		 737 aa  230  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  29.47 
 
 		 722 aa  230  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  30.64 
 
 		 727 aa  230  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.87 
 
 		 738 aa  229  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  29.34 
 
 		 734 aa  229  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  29.45 
 
 		 723 aa  229  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.15 
 
 		 732 aa  229  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  30.83 
 
 		 735 aa  227  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  30.41 
 
 		 722 aa  227  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  30.41 
 
 		 722 aa  227  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  30.41 
 
 		 722 aa  227  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  30.41 
 
 		 722 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  30.5 
 
 		 727 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  30.64 
 
 		 727 aa  227  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 787 aa  227  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  28.77 
 
 		 726 aa  226  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  33.08 
 
 		 709 aa  226  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  29.95 
 
 		 722 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 709 aa  226  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  28.94 
 
 		 724 aa  226  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  30.22 
 
 		 771 aa  225  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  29.82 
 
 		 720 aa  225  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  32.3 
 
 		 457 aa  225  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.08 
 
 		 737 aa  225  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.02 
 
 		 794 aa  224  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.54 
 
 		 795 aa  224  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  28.95 
 
 		 721 aa  224  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.38 
 
 		 747 aa  224  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  31.49 
 
 		 717 aa  224  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.85 
 
 		 802 aa  224  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  29.85 
 
 		 722 aa  224  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.55 
 
 		 753 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  29.95 
 
 		 722 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  30.08 
 
 		 723 aa  224  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  30.34 
 
 		 721 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.32 
 
 		 831 aa  223  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.37 
 
 		 730 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  29.95 
 
 		 722 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.26 
 
 		 741 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.55 
 
 		 753 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.16 
 
 		 794 aa  223  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 		 738 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  29.95 
 
 		 722 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.92 
 
 		 751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.24 
 
 		 806 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.92 
 
 		 747 aa  222  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  28.92 
 
 		 751 aa  222  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>