More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0810 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  100 
 
 
366 aa  733  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 
368 aa  279  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  40.06 
 
 
368 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  37.77 
 
 
377 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 
376 aa  271  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  41.76 
 
 
376 aa  270  3e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  38.61 
 
 
375 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  38.83 
 
 
377 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 
376 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  39.63 
 
 
377 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  38.54 
 
 
373 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  38.77 
 
 
381 aa  263  5e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  41.03 
 
 
370 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  36.1 
 
 
378 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  38.25 
 
 
368 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 
405 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 
377 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 
377 aa  254  2e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  37.03 
 
 
375 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  37.23 
 
 
369 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  38.56 
 
 
376 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
376 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  36.63 
 
 
376 aa  245  7e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  36.15 
 
 
379 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
376 aa  244  1e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  36.12 
 
 
376 aa  244  1e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  37.47 
 
 
376 aa  242  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 
377 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 
369 aa  236  5e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  36.02 
 
 
369 aa  233  4e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  35.59 
 
 
427 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  35.64 
 
 
367 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 
369 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  35.54 
 
 
377 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 
380 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  35.92 
 
 
378 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 
371 aa  226  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  34.34 
 
 
382 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  35.42 
 
 
387 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  37.47 
 
 
364 aa  222  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  36.1 
 
 
377 aa  221  1e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  35.69 
 
 
366 aa  220  2e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 
371 aa  221  2e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  32.27 
 
 
371 aa  221  2e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.22 
 
 
378 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  34.25 
 
 
379 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 
370 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  35.54 
 
 
378 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
375 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  35.2 
 
 
376 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 
366 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.46 
 
 
365 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.31089e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 
373 aa  217  3e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 
375 aa  216  6e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 
373 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 
373 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  39.51 
 
 
378 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  34.22 
 
 
378 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  34.93 
 
 
376 aa  215  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  34.93 
 
 
376 aa  215  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  35.85 
 
 
391 aa  215  1e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  34.93 
 
 
376 aa  215  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  36.39 
 
 
391 aa  214  1e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 
373 aa  215  1e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  34.93 
 
 
376 aa  215  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  35.31 
 
 
373 aa  215  1e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 
373 aa  214  2e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  34.22 
 
 
373 aa  213  3e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  35.56 
 
 
377 aa  213  4e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 
377 aa  213  4e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 
377 aa  213  4e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  35.56 
 
 
377 aa  213  4e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 
384 aa  213  4e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  35.56 
 
 
377 aa  213  4e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.56 
 
 
377 aa  213  4e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  35.56 
 
 
377 aa  213  4e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  35.56 
 
 
377 aa  213  4e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
373 aa  213  5e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  35.56 
 
 
377 aa  213  6e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
373 aa  212  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  34.25 
 
 
369 aa  212  8e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  35.15 
 
 
366 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 
377 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  33.87 
 
 
374 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  35.04 
 
 
373 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  34.59 
 
 
368 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 
373 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
378 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  38.67 
 
 
376 aa  209  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  37.6 
 
 
380 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  35.01 
 
 
370 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 
388 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 
378 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 
368 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  37.06 
 
 
380 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  37.06 
 
 
380 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  35.5 
 
 
390 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.1 
 
 
380 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  31.89 
 
 
384 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  33.07 
 
 
375 aa  205  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>