More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0517 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0517  tfp pilus assembly protein, major pilin  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000683927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  45.21 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  47.76 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  65.96 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  40 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  46.38 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  41.77 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  38.16 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  39.18 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  37.23 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  61.9 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  50.91 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  38.3 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  38.04 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  38.04 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  35.42 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  36.96 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  38.04 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1399  N-terminal methylation  58.21 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  51.92 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  40.35 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  78.12 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  46.15 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  44.26 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  48.08 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  32.84 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15291  Tfp pilus assembly protein PilE  28.78 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.420018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.06 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  28.23 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  44.62 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  44.64 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  49.09 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  56.82 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  47.37 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  36.92 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  56.82 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  52.5 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  50.94 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  67.57 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  50.98 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  51.11 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  48.15 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  77.42 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  75.86 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  39.76 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  68.75 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  39.76 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.09 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  75.86 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  65.71 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  62.16 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  33.33 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  74.19 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  58.14 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  61.7 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  43.42 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  34.12 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  34.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  41.94 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  72.41 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  37.8 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  43.94 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  38.1 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  30.49 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  70.59 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40.98 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  29.91 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  30.89 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  34.67 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  34.83 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40.91 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  50.98 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  35.64 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  33.75 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  52.54 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  65.62 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  34.86 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  49.18 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  68.75 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  68.75 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  40.32 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  32.73 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  58.54 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  72.73 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>