110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15291 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_15291  Tfp pilus assembly protein PilE  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.420018  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  47.56 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  42.31 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  42.31 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  38.36 
 
 
135 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  40.91 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  30.38 
 
 
188 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  54.35 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  36.21 
 
 
186 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  34.67 
 
 
159 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  46.15 
 
 
174 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  46.15 
 
 
174 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  36.21 
 
 
186 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  38.78 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  32.1 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  30.17 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08251  hypothetical protein  37.25 
 
 
430 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.328672  decreased coverage  0.0000133255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  55.56 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  35.06 
 
 
129 aa  45.1  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  31.86 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
154 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  33.33 
 
 
186 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  40.43 
 
 
163 aa  44.7  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  32.1 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  28.57 
 
 
139 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  30.63 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  44.44 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  44.44 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.3 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  45.24 
 
 
114 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  33.33 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  32.39 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  35.38 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  50 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  50 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  29.91 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  51.22 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  51.28 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  63.64 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  30.97 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  34.58 
 
 
319 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  74.07 
 
 
129 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  46.81 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.57 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  45 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  51.16 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  44.12 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  44.44 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  44.44 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  55.26 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15091  Type II secretory pathway, pseudopilin PulG  35.85 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0724154  normal  0.298233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  44.44 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.78 
 
 
121 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  46.51 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  47.5 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  48.65 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  34.04 
 
 
149 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  44.74 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  52.63 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  48.28 
 
 
173 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  42.55 
 
 
150 aa  42  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  52.78 
 
 
145 aa  42  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  47.5 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  37.04 
 
 
152 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  35.94 
 
 
147 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  45.24 
 
 
121 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  33.96 
 
 
156 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  36.84 
 
 
160 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  45.24 
 
 
211 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  40.48 
 
 
160 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  40.48 
 
 
178 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  50 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  50 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  38.57 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  35.38 
 
 
124 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  45 
 
 
138 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  44.74 
 
 
140 aa  41.6  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  52.5 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  32.84 
 
 
167 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  50 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  47.17 
 
 
173 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  50 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  50 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  50 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  55.56 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 
150 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  52.78 
 
 
163 aa  41.6  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  50 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
152 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  29.85 
 
 
169 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  34.43 
 
 
138 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  34.78 
 
 
149 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  30.11 
 
 
143 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  44.9 
 
 
166 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  50 
 
 
145 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  41.46 
 
 
147 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>