14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_08251 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_08251  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.328672  decreased coverage  0.0000133255 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15291  Tfp pilus assembly protein PilE  37.25 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.420018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  29.82 
 
 		 174 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  45.95 
 
 		 151 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  27.62 
 
 		 189 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.35 
 
 		 163 aa  43.9  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 		 160 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  45.95 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  45.95 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  45.95 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  28.26 
 
 		 168 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  45.95 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  45.95 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15091  Type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.82 
 
 		 216 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0724154  normal  0.298233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>