More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4047 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  44.05 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  46.05 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  42.22 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.17 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  45.54 
 
 		 231 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.05 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  44.75 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  44.59 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  41.85 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  43.38 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  38.29 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  40.79 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  44.1 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.48 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  40.53 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  40.93 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.74 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  46.57 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  39.13 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  37.1 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  41.23 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  37.22 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  43.13 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  39.64 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.12 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  41.56 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.83 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  37.61 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.88 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.92 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  40.49 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  39.73 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.85 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  40.34 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  41.23 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  35.4 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  37.56 
 
 		 202 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  41.13 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  42.38 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  39.47 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.15 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  40.35 
 
 		 270 aa  151  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  39.63 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  41.86 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  40.38 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  40.98 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  37.34 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  37.7 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  41.77 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  38.2 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  41.03 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  42.31 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  41.92 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  38.5 
 
 		 216 aa  148  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  42.11 
 
 		 235 aa  148  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  38.53 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  39.81 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  38.6 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  38.6 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  35.84 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  40.17 
 
 		 271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  39.32 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  41.28 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  36.59 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  35.84 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  35.84 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  35.84 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  35.84 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  35.84 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  36.8 
 
 		 275 aa  144  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  38.53 
 
 		 227 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  38.82 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  36 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  36 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  35.4 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  34.51 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  36.91 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>