129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3591 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  45.93 
 
 		 904 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  44.85 
 
 		 885 aa  722    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  58.16 
 
 		 907 aa  1031    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  45.93 
 
 		 899 aa  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  44.57 
 
 		 906 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  45.75 
 
 		 887 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  45.52 
 
 		 887 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  45.76 
 
 		 899 aa  734    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 912 aa  1857    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  42.54 
 
 		 899 aa  621  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  39.51 
 
 		 921 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  41.93 
 
 		 908 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  42.63 
 
 		 897 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  43.18 
 
 		 915 aa  557  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  40.21 
 
 		 912 aa  551  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  39.02 
 
 		 892 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  37.19 
 
 		 920 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  38.61 
 
 		 897 aa  425  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  36.14 
 
 		 892 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  38.02 
 
 		 897 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  39.29 
 
 		 701 aa  388  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  33.08 
 
 		 887 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  32.12 
 
 		 888 aa  282  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  31.27 
 
 		 883 aa  281  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  32.28 
 
 		 888 aa  280  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  32.32 
 
 		 888 aa  277  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  31.64 
 
 		 944 aa  268  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  32.58 
 
 		 854 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  29.84 
 
 		 823 aa  259  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  33.63 
 
 		 899 aa  247  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  34.64 
 
 		 905 aa  247  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.43 
 
 		 885 aa  237  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  31.25 
 
 		 927 aa  236  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.14 
 
 		 971 aa  231  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  29.72 
 
 		 854 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.6 
 
 		 970 aa  227  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  30.06 
 
 		 887 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  29.73 
 
 		 965 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  29.7 
 
 		 948 aa  224  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  28.02 
 
 		 908 aa  224  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.67 
 
 		 944 aa  223  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  30.04 
 
 		 879 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  30.18 
 
 		 868 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  41.31 
 
 		 456 aa  217  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  30.98 
 
 		 881 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  29.31 
 
 		 871 aa  217  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  31.68 
 
 		 860 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  30.02 
 
 		 871 aa  214  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.29 
 
 		 1540 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  30.56 
 
 		 837 aa  210  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  36.59 
 
 		 922 aa  209  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  27.72 
 
 		 860 aa  206  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  29.49 
 
 		 888 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  30.89 
 
 		 919 aa  204  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  29.54 
 
 		 968 aa  201  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  32.04 
 
 		 943 aa  194  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  31.59 
 
 		 876 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  32.39 
 
 		 901 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  29.62 
 
 		 933 aa  191  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  29.65 
 
 		 929 aa  191  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  32.1 
 
 		 594 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.22 
 
 		 962 aa  188  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  31.28 
 
 		 857 aa  181  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.01 
 
 		 885 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  27.75 
 
 		 918 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  27.48 
 
 		 832 aa  174  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  30.8 
 
 		 986 aa  171  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 729 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  26.73 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.01 
 
 		 737 aa  107  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  26.17 
 
 		 750 aa  104  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  28.74 
 
 		 801 aa  101  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  26.24 
 
 		 741 aa  99  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  30.73 
 
 		 779 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 1027 aa  98.6  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 781 aa  95.5  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  25.99 
 
 		 917 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  27.54 
 
 		 762 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  25.21 
 
 		 763 aa  91.3  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  28.03 
 
 		 783 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  32.45 
 
 		 850 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  28.18 
 
 		 804 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  30.28 
 
 		 811 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  27.44 
 
 		 795 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  24.84 
 
 		 778 aa  78.6  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.6 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 		 827 aa  74.7  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.97 
 
 		 726 aa  72  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.73 
 
 		 744 aa  71.2  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  25.45 
 
 		 821 aa  66.6  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  22.27 
 
 		 729 aa  67  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  27.01 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  23.42 
 
 		 914 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  28.46 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  28.39 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  23.2 
 
 		 764 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  27.14 
 
 		 799 aa  61.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  22.71 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  23.14 
 
 		 784 aa  58.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  28.57 
 
 		 843 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>