163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2639 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  100 
 
 
285 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  50.65 
 
 
287 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  45.42 
 
 
288 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  59.14 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  58.43 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  58.43 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  58.43 
 
 
286 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  58.43 
 
 
273 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  57.3 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  58.62 
 
 
270 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  58.62 
 
 
264 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  53.76 
 
 
275 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  47.31 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  49.43 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  51.09 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  42.14 
 
 
193 aa  96.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  51.09 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  51.09 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  58.62 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  41.73 
 
 
248 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  48.81 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  57.95 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  52.87 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  36.63 
 
 
212 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  45.65 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  48.84 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  43.01 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  42.39 
 
 
233 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  42.39 
 
 
233 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  50.55 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  43.01 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  45.56 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  50.57 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  46.09 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  46.09 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  45.35 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  45.74 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  45 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  48.81 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  32.16 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  37.78 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  37.96 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  44.05 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  43.48 
 
 
137 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32.56 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  43.3 
 
 
117 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  38.46 
 
 
218 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  43.48 
 
 
137 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  37.18 
 
 
215 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  45.45 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  44 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  37.04 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  37.66 
 
 
443 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  38.75 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  32.97 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.46 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  38.38 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  36.84 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  38.46 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  39.24 
 
 
212 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  35.37 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  31.31 
 
 
243 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  31.31 
 
 
226 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  43.42 
 
 
219 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  43.42 
 
 
219 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  40 
 
 
230 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  38.95 
 
 
310 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  27.7 
 
 
938 aa  52.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.51 
 
 
237 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  38.75 
 
 
138 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
215 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  36.71 
 
 
246 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  28.99 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  32.91 
 
 
242 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  32.32 
 
 
243 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  32.32 
 
 
243 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  36.05 
 
 
267 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  35.53 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  34.18 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  28.68 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  32.32 
 
 
226 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  31.31 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  37.04 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  27.31 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37.66 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  27.08 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  30.16 
 
 
208 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  36.14 
 
 
138 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  32.91 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  38.3 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  33.33 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  35.53 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  36.59 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  34.18 
 
 
223 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  37.5 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  35.53 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  35.53 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  35.53 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  32.65 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  35.53 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>