More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5671 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 531 aa  1083    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  57.87 
 
 		 532 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  59.73 
 
 		 533 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  70.67 
 
 		 530 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  60.49 
 
 		 539 aa  627  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  53.22 
 
 		 530 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 529 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  35.89 
 
 		 529 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  35.51 
 
 		 529 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  38.14 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 		 534 aa  316  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.53 
 
 		 532 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  36.91 
 
 		 528 aa  297  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 544 aa  294  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  35.29 
 
 		 534 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  36.51 
 
 		 524 aa  293  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.26 
 
 		 534 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  35.64 
 
 		 524 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.42 
 
 		 539 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 535 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 544 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 516 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.15 
 
 		 542 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 535 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.33 
 
 		 515 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 		 534 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  34.15 
 
 		 533 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 534 aa  272  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  33.95 
 
 		 538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  34.38 
 
 		 495 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 536 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  32.45 
 
 		 516 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  35.04 
 
 		 537 aa  269  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 538 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  34.46 
 
 		 538 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.09 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  34.49 
 
 		 536 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  34.18 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 		 517 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 		 538 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 527 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 522 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.74 
 
 		 531 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  34.49 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.63 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  32.6 
 
 		 560 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  32.52 
 
 		 527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 528 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 531 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.35 
 
 		 531 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  30.82 
 
 		 553 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.11 
 
 		 546 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.34 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.51 
 
 		 538 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 565 aa  170  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.55 
 
 		 540 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.16 
 
 		 511 aa  163  9e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.62 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 559 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.71 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 532 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.51 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.51 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.51 
 
 		 528 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 527 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 540 aa  160  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.86 
 
 		 529 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.51 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.51 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.86 
 
 		 529 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 563 aa  158  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 531 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 529 aa  157  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.71 
 
 		 511 aa  157  7e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 535 aa  156  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.4 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.31 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 535 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 		 534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 533 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 511 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.95 
 
 		 532 aa  153  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>