More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0079 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  100 
 
 		 361 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  67.95 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  58.54 
 
 		 337 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  61.54 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  59.14 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  47.02 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  47.2 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  50.33 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  51.8 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  47.24 
 
 		 594 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  52.6 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  55.25 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  53.05 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  47.99 
 
 		 597 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  51.57 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.64 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 346 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  43.99 
 
 		 313 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 333 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  46.34 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  41.09 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 652 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  43.16 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  39.49 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 411 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  40 
 
 		 318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1383  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3641  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  44.53 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3828  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 406 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.75 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3133  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0698666  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3716  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  35.31 
 
 		 322 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6573  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176253  normal  0.0417549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.08 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  39.84 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5726  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6090  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  35.97 
 
 		 838 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1796  branched-chain amino acid ABC transporter permease  33.54 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  35.35 
 
 		 852 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1936  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.54 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 342 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>