More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2284 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  70.09 
 
 		 1427 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  69.51 
 
 		 1040 aa  704    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  69.68 
 
 		 1024 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  70.89 
 
 		 717 aa  660    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  72.59 
 
 		 1058 aa  683    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  65.54 
 
 		 987 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  83.49 
 
 		 1265 aa  898    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  76.56 
 
 		 1048 aa  715    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  78.12 
 
 		 908 aa  728    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 1117 aa  2149    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  82.26 
 
 		 944 aa  796    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  57.48 
 
 		 1093 aa  644    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  77.98 
 
 		 1244 aa  697    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  72.06 
 
 		 1091 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  57.57 
 
 		 1123 aa  675    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  75.7 
 
 		 1194 aa  726    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  77.37 
 
 		 922 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  77.59 
 
 		 1334 aa  756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  78.19 
 
 		 952 aa  753    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  65.54 
 
 		 991 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  76.79 
 
 		 990 aa  724    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  81.99 
 
 		 1018 aa  813    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  69.12 
 
 		 974 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  68.84 
 
 		 1041 aa  735    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  84.72 
 
 		 1043 aa  889    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  68.78 
 
 		 1016 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  72.69 
 
 		 1093 aa  717    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  74.84 
 
 		 1113 aa  730    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  74.67 
 
 		 959 aa  688    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  75.21 
 
 		 1007 aa  721    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  68.8 
 
 		 953 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  74.12 
 
 		 702 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  62.59 
 
 		 1080 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  74.95 
 
 		 1070 aa  712    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  65.54 
 
 		 991 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  70.94 
 
 		 1151 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  65.52 
 
 		 961 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  66.81 
 
 		 1022 aa  633  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  47.82 
 
 		 457 aa  412  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  41.56 
 
 		 562 aa  326  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  43.14 
 
 		 559 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  45.06 
 
 		 636 aa  319  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  40.64 
 
 		 492 aa  317  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  42.82 
 
 		 497 aa  316  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  38.82 
 
 		 494 aa  314  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  42.96 
 
 		 497 aa  313  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.9 
 
 		 564 aa  313  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.43 
 
 		 483 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  39.04 
 
 		 496 aa  306  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  39.04 
 
 		 496 aa  306  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  42.86 
 
 		 411 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.59 
 
 		 543 aa  305  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  42.89 
 
 		 571 aa  303  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  39.06 
 
 		 503 aa  303  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  41.61 
 
 		 492 aa  301  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  44.03 
 
 		 485 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  43.78 
 
 		 485 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  39.74 
 
 		 497 aa  296  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  41.05 
 
 		 496 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.19 
 
 		 531 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  39.67 
 
 		 503 aa  294  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  41.05 
 
 		 496 aa  294  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40.2 
 
 		 489 aa  293  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  43.75 
 
 		 485 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  43.75 
 
 		 485 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  39.85 
 
 		 495 aa  292  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  39.85 
 
 		 495 aa  293  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  43.75 
 
 		 485 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  40 
 
 		 490 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  39.75 
 
 		 491 aa  291  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  43 
 
 		 492 aa  291  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  40.2 
 
 		 489 aa  291  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  40.25 
 
 		 489 aa  290  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  36.77 
 
 		 528 aa  290  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  40.2 
 
 		 489 aa  290  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  43.5 
 
 		 485 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0479  ribonuclease  37.11 
 
 		 1368 aa  288  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  43.25 
 
 		 487 aa  287  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  37.5 
 
 		 530 aa  287  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  38.83 
 
 		 499 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  38.06 
 
 		 501 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  42.4 
 
 		 485 aa  286  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  40 
 
 		 496 aa  286  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  36.95 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  37 
 
 		 528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  37.53 
 
 		 517 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  38.1 
 
 		 1056 aa  285  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  38.88 
 
 		 517 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  43 
 
 		 485 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  37.47 
 
 		 476 aa  284  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  39.78 
 
 		 938 aa  284  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0282  ribonuclease  36.14 
 
 		 1449 aa  283  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.936888  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  40 
 
 		 489 aa  283  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  37.77 
 
 		 515 aa  283  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  40 
 
 		 489 aa  282  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  40 
 
 		 489 aa  282  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  40 
 
 		 489 aa  282  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  39.75 
 
 		 489 aa  282  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  40 
 
 		 489 aa  282  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>