More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1232 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 490 aa  1006    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  58.72 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  53.18 
 
 		 837 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  73.82 
 
 		 951 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  66.18 
 
 		 509 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  66 
 
 		 524 aa  269  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  46.15 
 
 		 285 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  61.62 
 
 		 1122 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  59.9 
 
 		 965 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  46.15 
 
 		 640 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  54.89 
 
 		 536 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  45.96 
 
 		 560 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  59.9 
 
 		 1015 aa  236  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  60 
 
 		 604 aa  236  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  59.41 
 
 		 541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  53.56 
 
 		 780 aa  234  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  58 
 
 		 928 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  44 
 
 		 638 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  56.13 
 
 		 746 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  60.8 
 
 		 1164 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  43.82 
 
 		 305 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  54.08 
 
 		 535 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  53.66 
 
 		 629 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  45.67 
 
 		 533 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  45.45 
 
 		 679 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  36.54 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  35.42 
 
 		 392 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  33.82 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  54.26 
 
 		 912 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  43.06 
 
 		 683 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  52.45 
 
 		 618 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  36.94 
 
 		 359 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  48.85 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  37.2 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  31.95 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  34.02 
 
 		 369 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  40.29 
 
 		 630 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  34.43 
 
 		 375 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  32.17 
 
 		 385 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  31.8 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  31.93 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  32.93 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  30.68 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  48.46 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  46.97 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  37.79 
 
 		 1290 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  50.75 
 
 		 566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  48.46 
 
 		 479 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  30.33 
 
 		 286 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1670  putative esterase  28.52 
 
 		 395 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  27.09 
 
 		 882 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  37.33 
 
 		 276 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1707  putative esterase  27.56 
 
 		 394 aa  101  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  39.46 
 
 		 1186 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2433  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.78 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2738  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.05 
 
 		 394 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  25.98 
 
 		 389 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  41.79 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  26.09 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  28.29 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  25.59 
 
 		 398 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  25.59 
 
 		 398 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  25.59 
 
 		 364 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  44.23 
 
 		 383 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  30.04 
 
 		 319 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  32.43 
 
 		 342 aa  86.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.86 
 
 		 945 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  38.1 
 
 		 630 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.91 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  36.46 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  30.77 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  27.13 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 1077 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  32.24 
 
 		 884 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  36.22 
 
 		 1444 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  32.29 
 
 		 1132 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  26.72 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  26.72 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  26.72 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 773 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  26.72 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  41.01 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  27.2 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  28.12 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  27.2 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  27.2 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  27.2 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  27.2 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  31.16 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  27.2 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  27.2 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  28.12 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  34.57 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  34.27 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32905  hypothetical protein  26.32 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.954654  hitchhiker  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2799  hypothetical protein  26.32 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.4 
 
 		 953 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  24.51 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>