More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1151 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  65.49 
 
 		 227 aa  322  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  64.16 
 
 		 227 aa  315  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  62.61 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  56.76 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  53.42 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  56.76 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  53.39 
 
 		 225 aa  254  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.53 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 244 aa  247  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.95 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  50.45 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 		 279 aa  245  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.56 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  51.82 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  48.84 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  48.84 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 291 aa  241  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  47.79 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.94 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  50.94 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  46.19 
 
 		 277 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  51.16 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  48.37 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  49.08 
 
 		 258 aa  234  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  48.17 
 
 		 269 aa  234  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  49.06 
 
 		 258 aa  233  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.82 
 
 		 259 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.11 
 
 		 274 aa  232  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  49.1 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  48.84 
 
 		 264 aa  231  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.89 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  49.54 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  50.95 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 256 aa  227  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  47.64 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.67 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  46.54 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  46.33 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  47.64 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  47.37 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  50 
 
 		 250 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  46.54 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  49.55 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 243 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  45.62 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  49.29 
 
 		 445 aa  222  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.73 
 
 		 244 aa  221  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  47.44 
 
 		 256 aa  221  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 312 aa  221  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  54.67 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  47.69 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  47.09 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  46.72 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  46.54 
 
 		 455 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.02 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  45.7 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 302 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  48.89 
 
 		 248 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.3 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  49.32 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  48.44 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  46.4 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  47.75 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.79 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.79 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.64 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.13 
 
 		 251 aa  214  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  46.02 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  46.02 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  45.25 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  49.55 
 
 		 653 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  51.12 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  48.57 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  44.25 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 261 aa  211  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  48.65 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  45.18 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>