More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1027 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  100 
 
 
464 aa  937    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  39.68 
 
 
569 aa  272  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  38.94 
 
 
490 aa  253  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  35.83 
 
 
533 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  35.23 
 
 
468 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.94 
 
 
447 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.86 
 
 
503 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.6 
 
 
741 aa  209  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  36.75 
 
 
676 aa  209  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  39.79 
 
 
680 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  34.93 
 
 
674 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.48 
 
 
472 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  34.42 
 
 
475 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  38.49 
 
 
681 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  42.21 
 
 
646 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.38 
 
 
687 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  39.79 
 
 
676 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  41.02 
 
 
681 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.74 
 
 
473 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.95 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  40.48 
 
 
692 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  37.97 
 
 
695 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.89 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.89 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.59 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  40.48 
 
 
690 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.31 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  35.01 
 
 
471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35.01 
 
 
471 aa  200  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  34.82 
 
 
695 aa  200  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  42.7 
 
 
490 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  34.45 
 
 
665 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  41.67 
 
 
645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  34.89 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  35.55 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  35.55 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  35.26 
 
 
437 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  32.69 
 
 
435 aa  193  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.39 
 
 
448 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.52 
 
 
517 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  42.54 
 
 
362 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  34.05 
 
 
699 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  51.1 
 
 
651 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35 
 
 
503 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  34.42 
 
 
429 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  40 
 
 
640 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  34.05 
 
 
524 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  40.16 
 
 
648 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  51.1 
 
 
651 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  39.61 
 
 
640 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  33.19 
 
 
697 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  34.14 
 
 
527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  40.82 
 
 
697 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  49.45 
 
 
651 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.81 
 
 
480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.51 
 
 
477 aa  183  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.07 
 
 
470 aa  183  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  30.07 
 
 
479 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  31.2 
 
 
490 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  34.66 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  32.58 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  41.18 
 
 
615 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  37.98 
 
 
646 aa  180  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  37.83 
 
 
683 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  31.64 
 
 
429 aa  176  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  39.04 
 
 
621 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  31.04 
 
 
437 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  34.02 
 
 
430 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  30.38 
 
 
470 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.3 
 
 
441 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  36.56 
 
 
523 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  37.69 
 
 
406 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  27.59 
 
 
460 aa  171  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  30.1 
 
 
656 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  30.62 
 
 
465 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  32.99 
 
 
441 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  32.02 
 
 
513 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  30.53 
 
 
475 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  35.02 
 
 
433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.65 
 
 
312 aa  165  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  37.63 
 
 
353 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  29.04 
 
 
475 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  31.61 
 
 
462 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  32.97 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  36.17 
 
 
513 aa  162  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  29.32 
 
 
482 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  30.39 
 
 
439 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  36.24 
 
 
389 aa  159  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  29.16 
 
 
470 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  32.67 
 
 
439 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  33.22 
 
 
459 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  35.71 
 
 
577 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  31.35 
 
 
402 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  31.67 
 
 
419 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  37.59 
 
 
464 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  31.25 
 
 
512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  34.96 
 
 
417 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  34.27 
 
 
498 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  35.36 
 
 
577 aa  156  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  33.96 
 
 
465 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>