More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0375 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
354 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  55.52 
 
 
346 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  55.24 
 
 
346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  47.7 
 
 
342 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  46.29 
 
 
344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  47.7 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  46.26 
 
 
347 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  45.98 
 
 
347 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  47.88 
 
 
344 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  45.11 
 
 
341 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  44.86 
 
 
344 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  45.4 
 
 
347 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  46.97 
 
 
346 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  45.4 
 
 
347 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  46.4 
 
 
346 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  48.73 
 
 
344 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  42 
 
 
343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  44.13 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  47.88 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  45.87 
 
 
345 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  42.29 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  45.01 
 
 
342 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  46.44 
 
 
345 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  44.32 
 
 
341 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  46.72 
 
 
345 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  41.38 
 
 
341 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  42.55 
 
 
357 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  44.69 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  45.33 
 
 
345 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  41.95 
 
 
341 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  44.35 
 
 
356 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  44.51 
 
 
343 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  45.45 
 
 
346 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  44.32 
 
 
341 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  43.59 
 
 
341 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  39.71 
 
 
337 aa  245  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  41.97 
 
 
341 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  41.48 
 
 
342 aa  243  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  41.44 
 
 
340 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  41.69 
 
 
342 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  44.48 
 
 
353 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  40.79 
 
 
342 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  39.22 
 
 
368 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 
340 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  42.82 
 
 
353 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  39.89 
 
 
340 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  37.18 
 
 
577 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  38.73 
 
 
578 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  40.17 
 
 
340 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  40.17 
 
 
340 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  39.89 
 
 
340 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  39.89 
 
 
340 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  40.73 
 
 
340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  44.31 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  40.29 
 
 
340 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.29 
 
 
340 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  40.23 
 
 
340 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  39.39 
 
 
341 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  39.39 
 
 
341 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.23 
 
 
340 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.23 
 
 
340 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.23 
 
 
340 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.23 
 
 
340 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  39.39 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  39.28 
 
 
340 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  39.39 
 
 
340 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  39.39 
 
 
340 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  35.8 
 
 
325 aa  200  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  33.93 
 
 
315 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  39.66 
 
 
340 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  36.8 
 
 
582 aa  198  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  39 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  37.99 
 
 
340 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  36.57 
 
 
407 aa  182  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.69 
 
 
340 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.23 
 
 
344 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  34.9 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.74 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  32.31 
 
 
344 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  34.02 
 
 
369 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.93 
 
 
380 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  39.83 
 
 
346 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  33.87 
 
 
365 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  34.32 
 
 
373 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  34.78 
 
 
334 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  33.23 
 
 
379 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  35.17 
 
 
369 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  35.07 
 
 
369 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  35.17 
 
 
369 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.03 
 
 
380 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  34.2 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  45.55 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  31.96 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  32.59 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  39.44 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.01 
 
 
364 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  34.12 
 
 
372 aa  139  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  32.42 
 
 
344 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>